RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOXA2	O43364	376 aa		9.47	□□□□□ -0.89
RABGGTB-212	ENST00000491266	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		9.47	□□□□□ -0.89
RABGGTB-212	ENST00000491266	NCOA2	Q15596	1464 aa		9.47	□□□□□ -0.89
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.89
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC4A3	P48751	1232 aa		9.46	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		9.46	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRCH3	Q96II8	777 aa		9.46	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASXL2	Q76L83	1435 aa		9.46	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFH	P08603	1231 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	NECTIN2	Q92692	538 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF14	Q15058	1648 aa		9.45	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFV2	P19404	249 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		9.44	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	MMRN1	Q13201	1228 aa		9.43	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	LILRB3	O75022	631 aa		9.42	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		9.41	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	FUT2	Q10981	343 aa		9.41	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		9.41	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	STAC3	Q96MF2	364 aa		9.41	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		9.41	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	9.41	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		9.4	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		9.4	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF40	O75150	1001 aa		9.4	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	FDX1	P10109	184 aa		9.4	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCAM	P50895	628 aa		9.4	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	C14orf37	Q86TY3	774 aa		9.4	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	WNT2B	Q93097	391 aa		9.4	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-C	Q95604	372 aa		9.4	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		9.4	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		9.4	□□□□□ -0.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTPRK	Q15262	1439 aa		9.39	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		9.39	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		9.39	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP6V1A	P38606	617 aa		9.39	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	RFC5	P40937	340 aa		9.39	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	FLII	Q13045	1269 aa		9.39	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	QPCT	Q16769	361 aa		9.39	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		9.39	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAPKBP1	O60336	1514 aa		9.39	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		9.38	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	GUCA2A	Q02747	115 aa		9.38	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		9.38	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRR14	Q9BWN1	585 aa		9.38	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	MORN1	Q5T089	497 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	BANK1	Q8NDB2	785 aa		9.37	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	HRC	P23327	699 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	APLP1	P51693	650 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP4C	P60510	307 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLCH2	O75038	1416 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		9.36	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	MCM6	Q14566	821 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIA2	Q96PC5	1412 aa		9.35	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	MBD5	Q9P267	1494 aa		9.34	□□□□□ -0.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOCS7	O14512	581 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	9.33	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	WBP1L	Q9NX94	342 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		9.33	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	9.33	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCC5	O15440	1437 aa		9.32	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		9.32	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	9.32	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	MTMR2	Q13614	643 aa		9.32	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	9.32	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		9.32	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD109	Q6YHK3	1445 aa		9.31	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		9.31	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		9.31	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	9.31	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	9.31	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	9.31	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		9.31	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLI2	P10070	1586 aa		9.31	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	DIP2B	Q9P265	1576 aa		9.31	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		9.3	□□□□□ -0.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITGAE	P38570	1179 aa		9.3	□□□□□ -0.92

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