RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.94■■□□□ 1.26
PRRT4-205ENST00000489835 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.92■■□□□ 1.26
PRRT4-205ENST00000489835 ITSN1Q15811 1721 aa22.92■■□□□ 1.26
PRRT4-205ENST00000489835 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.91■■□□□ 1.26
PRRT4-205ENST00000489835 C14orf37Q86TY3 774 aa22.91■■□□□ 1.26
PRRT4-205ENST00000489835 CFAP53Q96M91 514 aa22.91■■□□□ 1.26
PRRT4-205ENST00000489835 AKAP12Q02952 1782 aa22.91■■□□□ 1.26
PRRT4-205ENST00000489835 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.91■■□□□ 1.26
PRRT4-205ENST00000489835 MON2Q7Z3U7 1717 aa22.9■■□□□ 1.26
PRRT4-205ENST00000489835 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PRRT4-205ENST00000489835 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PRRT4-205ENST00000489835 INSRP06213 1382 aa22.89■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.89■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.88■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 COG3Q96JB2 828 aa22.87■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 SHPRHQ149N8 1683 aa22.86■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.86■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 USP6P35125 1406 aa22.86■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 APAF1O14727 1248 aa22.86■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 POLKQ9UBT6 870 aa22.86■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 NUDCQ9Y266 331 aa22.85■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.84■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.83■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
PRRT4-205ENST00000489835 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.82■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.82■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.81■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.81■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 SOX12O15370 315 aa22.8■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.8■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.79■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.79■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 NWD1Q149M9 1564 aa22.78■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 SSH2Q76I76 1423 aa22.78■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 NEUROD2Q15784 382 aa22.78■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.78■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.77■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
PRRT4-205ENST00000489835 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 PDE3BQ13370 1112 aa22.76■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 RUNDC1Q96C34 613 aa22.76■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 ORAI2Q96SN7 254 aa22.76■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.76■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.75■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.74■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 TMEM94Q12767 1356 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.73■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF521Q96K83 1311 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 STRCQ7RTU9 1775 aa22.72■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 NLRP6P59044 892 aa22.71■■□□□ 1.23
PRRT4-205ENST00000489835 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 ABTB2Q8N961 1025 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 FOXO3O43524 673 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 PSME1Q06323 249 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.7■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 GOLGA2Q08379 1002 aa22.69■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 HMOX1P09601 288 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 PIK3C2AO00443 1686 aa22.67■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 IL13P35225 146 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 WWC1Q8IX03 1113 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 USP31Q70CQ4 1352 aa22.66■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 PLEKHG5O94827 1062 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 ATF3P18847 181 aa22.65■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.64■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.64■■□□□ 1.22
PRRT4-205ENST00000489835 SLFN5Q08AF3 891 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.63■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 PRKAR2BP31323 418 aa22.62■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.61■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 FCHSD2O94868 740 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 NGEFQ8N5V2 710 aa22.6■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 PEAK1Q9H792 1746 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.59■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 AMPHP49418 695 aa22.58■■□□□ 1.21
PRRT4-205ENST00000489835 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.58■■□□□ 1.2
PRRT4-205ENST00000489835 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.58■■□□□ 1.2
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