RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.76□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.76□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 SPDYE5A6NIY4 337 aa9.74□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 DXOO77932 396 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 RFC5P40937 340 aa9.74□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 MMP16P51512 607 aa9.74□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF223E7ERA6 249 aa9.73□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 JUNDP17535 347 aa9.73□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 COG6Q9Y2V7 657 aa9.73□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 RAD21O60216 631 aa9.72□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 TSC1Q92574 1164 aa9.72□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 SNRKQ9NRH2 765 aa9.72□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.72□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
STRADBP1-201ENST00000478954 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 PLA2G2CQ5R387 149 aa9.71□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.71□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.69□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 DESI1Q6ICB0 168 aa9.69□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 AP1G2O75843 785 aa9.67□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.67□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 PTPRNQ16849 979 aa9.66□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 LYPD8Q6UX82 237 aa9.66□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 BANK1Q8NDB2 785 aa9.66□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.66□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 USP17L8P0C7I0 530 aa9.65□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 GGCXP38435 758 aa9.65□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 NUDT12Q9BQG2 462 aa9.65□□□□□ -0.86
STRADBP1-201ENST00000478954 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.64□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 MAP10Q9P2G4 905 aa9.64□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 CCNYL3P0C7X3 344 aa9.63□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.63□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 RETREG2Q8NC44 543 aa9.63□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 RGS20O76081 388 aa9.61□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM259Q4ZIN3 620 aa9.61□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.61□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.61□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 MTMR14Q8NCE2 650 aa9.61□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.61□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.6□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.6□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNH2Q12809 1159 aa9.59□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 IRF5Q13568 498 aa9.59□□□□□ -0.87
STRADBP1-201ENST00000478954 SMARCA4P51532 1647 aa9.58□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 CTHP32929 405 aa9.58□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 NR6A1Q15406 480 aa9.58□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.58□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 CHD1O14646 1710 aa9.57□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.57□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.57□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.57□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.55□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 POM121CA8CG34 1229 aa9.55□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC19A1P41440 591 aa9.55□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 SOCS7O14512 581 aa9.54□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 TRIM32Q13049 653 aa9.54□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXO41Q8TF61 875 aa9.54□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.54□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.53□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR37L1O60883 481 aa9.53□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 ABL2P42684 1182 aa9.53□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 LINC01559Q495D7 138 aa9.53□□□□□ -0.88
STRADBP1-201ENST00000478954 RPIAP49247 311 aa9.52□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 SKOR1P84550 965 aa9.52□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 SPRYD7Q5W111 196 aa9.52□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa9.52□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 ILDR2Q71H61 639 aa9.51□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 BAP1Q92560 729 aa9.51□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 GLMNQ92990 594 aa9.51□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 RGS22Q8NE09 1264 aa9.5□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 SH3BP2P78314 561 aa9.48□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.48□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 FKBPLQ9UIM3 349 aa9.48□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.48□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 HECW2Q9P2P5 1572 aa9.48□□□□□ -0.89
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms