RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.38■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 SSH2Q76I76 1423 aa28.38■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 COG3Q96JB2 828 aa28.37■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 C14orf37Q86TY3 774 aa28.34■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 NUDCQ9Y266 331 aa28.34■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.34■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.34■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 STRCQ7RTU9 1775 aa28.34■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.33■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.33■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 PDE3BQ13370 1112 aa28.33■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CTU2-202ENST00000453996 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.32■■■□□ 2.12
CTU2-202ENST00000453996 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.32■■■□□ 2.12
CTU2-202ENST00000453996 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.32■■■□□ 2.12
CTU2-202ENST00000453996 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.31■■■□□ 2.12
CTU2-202ENST00000453996 POLKQ9UBT6 870 aa28.29■■■□□ 2.12
CTU2-202ENST00000453996 PIK3C2AO00443 1686 aa28.28■■■□□ 2.12
CTU2-202ENST00000453996 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
CTU2-202ENST00000453996 NEFLP07196 543 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU2-202ENST00000453996 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.27■■■□□ 2.12
CTU2-202ENST00000453996 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CTU2-202ENST00000453996 USP54Q70EL1 1684 aa28.25■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 NGEFQ8N5V2 710 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 APAF1O14727 1248 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 FBLN1P23142 703 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 RUNDC1Q96C34 613 aa28.24■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.23■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.23■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 USP31Q70CQ4 1352 aa28.23■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.22■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 TMEM94Q12767 1356 aa28.21■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 ZNF521Q96K83 1311 aa28.21■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.21■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.2■■■□□ 2.11
CTU2-202ENST00000453996 KIF1AQ12756 1690 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU2-202ENST00000453996 DCCP43146 1447 aa28.19■■■□□ 2.1
CTU2-202ENST00000453996 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
CTU2-202ENST00000453996 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.18■■■□□ 2.1
CTU2-202ENST00000453996 FKBP8Q14318 412 aa28.18■■■□□ 2.1
CTU2-202ENST00000453996 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
CTU2-202ENST00000453996 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.17■■■□□ 2.1
CTU2-202ENST00000453996 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.15■■■□□ 2.1
CTU2-202ENST00000453996 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 PEAK1Q9H792 1746 aa28.13■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 GOLGA2Q08379 1002 aa28.13■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.13■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 ATF3P18847 181 aa28.11■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 NLRP6P59044 892 aa28.11■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 PSME1Q06323 249 aa28.11■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 ORAI2Q96SN7 254 aa28.11■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 MST1RQ04912 1400 aa28.11■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 IL13P35225 146 aa28.09■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 ABTB2Q8N961 1025 aa28.09■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.09■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.08■■■□□ 2.09
CTU2-202ENST00000453996 MSH6P52701 1360 aa28.07■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 FCHSD2O94868 740 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 SOX12O15370 315 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 WWC1Q8IX03 1113 aa28.06■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 CCDC27Q2M243 656 aa28.05■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.05■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.05■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 SLFN5Q08AF3 891 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 NEUROD2Q15784 382 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 SBNO1A3KN83 1393 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.04■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 FOXO3O43524 673 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 FLT4P35916 1363 aa28.03■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 E9PSI1 815 aa28.02■■■□□ 2.08
CTU2-202ENST00000453996 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.01■■■□□ 2.07
CTU2-202ENST00000453996 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CTU2-202ENST00000453996 KIF24Q5T7B8 1368 aa28■■■□□ 2.07
CTU2-202ENST00000453996 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CTU2-202ENST00000453996 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
CTU2-202ENST00000453996 LTN1O94822 1766 aa28■■■□□ 2.07
CTU2-202ENST00000453996 NEFMP07197 916 aa27.99■■■□□ 2.07
CTU2-202ENST00000453996 PRKAR2BP31323 418 aa27.99■■■□□ 2.07
CTU2-202ENST00000453996 TMPOP42166 694 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
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