RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MRS2Q9HD23 443 aa20.57■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PPP2R1AP30153 589 aa20.55■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CCDC184Q52MB2 194 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GGNBP2Q9H3C7 697 aa20.54■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SSH2Q76I76 1423 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.53■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ORAI2Q96SN7 254 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NME9Q86XW9 330 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PSME1Q06323 249 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COG3Q96JB2 828 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PIK3C2AO00443 1686 aa20.46■□□□□ 0.87
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 USP54Q70EL1 1684 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FOXO3O43524 673 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLAIN2Q9P270 581 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 USP31Q70CQ4 1352 aa20.45■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 OVOS2Q6IE36 1432 aa20.44■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRT28Q7Z3Y7 464 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.42■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MTHFSP49914 203 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABTB2Q8N961 1025 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.41■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BRINP3Q76B58 766 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CFAP53Q96M91 514 aa20.4■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NLRP6P59044 892 aa20.39■□□□□ 0.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ALS2Q96Q42 1657 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SBNO1A3KN83 1393 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PXDNQ92626 1479 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 POLKQ9UBT6 870 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NHSL1Q5SYE7 1610 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SHPRHQ149N8 1683 aa20.33■□□□□ 0.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 INSRP06213 1382 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TNS3Q68CZ2 1445 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FBLN1P23142 703 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SLIT3O75094 1523 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SOX12O15370 315 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TOM1O60784 492 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NUDCQ9Y266 331 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARHGEF10O15013 1369 aa20.28■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 USP19O94966 1318 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LTN1O94822 1766 aa20.27■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NFAT5O94916 1531 aa20.27■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KIF24Q5T7B8 1368 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PEAK1Q9H792 1746 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MAP3K19Q56UN5 1328 aa20.26■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FLT4P35916 1363 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 GCP02774 474 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 AMPHP49418 695 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.23■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 RTL1A6NKG5 1358 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CERKQ8TCT0 537 aa20.21■□□□□ 0.83
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.828e-7■■■■□ 21.5
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PHLPP1O60346 1717 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IL13P35225 146 aa20.19■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PLEKHG5O94827 1062 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HOXC9P31274 260 aa20.18■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.17■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
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