RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439830.5

ANKRD28-203, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 5

Gene ANKRD28, Length 592 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-203ENST00000439830 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
ANKRD28-203ENST00000439830 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP36.41■■■■□ 3.42
ANKRD28-203ENST00000439830 VPS72Q15906 364 aa36.41■■■■□ 3.42
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM83GA6ND36 823 aa36.38■■■■□ 3.41
ANKRD28-203ENST00000439830 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.38■■■■□ 3.41
ANKRD28-203ENST00000439830 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
ANKRD28-203ENST00000439830 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC61Q9Y6R9 512 aa36.36■■■■□ 3.41
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
ANKRD28-203ENST00000439830 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.33■■■■□ 3.41
ANKRD28-203ENST00000439830 ACEP12821 1306 aa36.32■■■■□ 3.4
ANKRD28-203ENST00000439830 BTG4Q9NY30 223 aa36.3■■■■□ 3.4
ANKRD28-203ENST00000439830 PLEKHG3A1L390 1219 aa36.29■■■■□ 3.4
ANKRD28-203ENST00000439830 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
ANKRD28-203ENST00000439830 CCDC125Q86Z20 511 aa36.28■■■■□ 3.4
ANKRD28-203ENST00000439830 SEPT12Q8IYM1 358 aa36.28■■■■□ 3.4
ANKRD28-203ENST00000439830 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.27■■■■□ 3.4
ANKRD28-203ENST00000439830 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.27■■■■□ 3.4
ANKRD28-203ENST00000439830 NEUROD1Q13562 356 aa36.26■■■■□ 3.4
ANKRD28-203ENST00000439830 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
ANKRD28-203ENST00000439830 PRDM11Q9NQV5 511 aa36.25■■■■□ 3.39
ANKRD28-203ENST00000439830 NRKQ7Z2Y5 1582 aa36.24■■■■□ 3.39
ANKRD28-203ENST00000439830 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
ANKRD28-203ENST00000439830 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP36.21■■■■□ 3.39
ANKRD28-203ENST00000439830 KIAA0232Q92628 1395 aa36.21■■■■□ 3.39
ANKRD28-203ENST00000439830 CABP2Q9NPB3 220 aa36.21■■■■□ 3.39
ANKRD28-203ENST00000439830 NUTM2GQ5VZR2 741 aa36.19■■■■□ 3.38
ANKRD28-203ENST00000439830 A0A0G2JS52 829 aa36.18■■■■□ 3.38
ANKRD28-203ENST00000439830 MYT1Q01538 1121 aa36.18■■■■□ 3.38
ANKRD28-203ENST00000439830 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa36.16■■■■□ 3.38
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
ANKRD28-203ENST00000439830 KRT27Q7Z3Y8 459 aa36.16■■■■□ 3.38
ANKRD28-203ENST00000439830 ABTB2Q8N961 1025 aa36.16■■■■□ 3.38
ANKRD28-203ENST00000439830 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa36.14■■■■□ 3.38
ANKRD28-203ENST00000439830 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa36.14■■■■□ 3.38
ANKRD28-203ENST00000439830 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
ANKRD28-203ENST00000439830 EVC2Q86UK5 1308 aa36.12■■■■□ 3.37
ANKRD28-203ENST00000439830 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
ANKRD28-203ENST00000439830 CHRNA2Q15822 529 aa36.11■■■■□ 3.37
ANKRD28-203ENST00000439830 AKAP12Q02952 1782 aa36.11■■■■□ 3.37
ANKRD28-203ENST00000439830 USP19O94966 1318 aa36.1■■■■□ 3.37
ANKRD28-203ENST00000439830 LMO7Q8WWI1 1683 aa36.1■■■■□ 3.37
ANKRD28-203ENST00000439830 USP6P35125 1406 aa36.1■■■■□ 3.37
ANKRD28-203ENST00000439830 CABP1Q9NZU7 370 aa36.08■■■■□ 3.37
ANKRD28-203ENST00000439830 CPDO75976 1380 aa36.07■■■■□ 3.36
ANKRD28-203ENST00000439830 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
ANKRD28-203ENST00000439830 RGPD1P0DJD0 1748 aa36.06■■■■□ 3.36
ANKRD28-203ENST00000439830 NLRP13Q86W25 1043 aa36.06■■■■□ 3.36
ANKRD28-203ENST00000439830 PIK3C2AO00443 1686 aa36.06■■■■□ 3.36
ANKRD28-203ENST00000439830 STRN4Q9NRL3 753 aa36.05■■■■□ 3.36
ANKRD28-203ENST00000439830 ZRANB1Q9UGI0 708 aa36.05■■■■□ 3.36
ANKRD28-203ENST00000439830 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa36.05■■■■□ 3.36
ANKRD28-203ENST00000439830 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa36.03■■■■□ 3.36
ANKRD28-203ENST00000439830 SSH2Q76I76 1423 aa36.02■■■■□ 3.36
ANKRD28-203ENST00000439830 SLIT3O75094 1523 aa36.01■■■■□ 3.36
ANKRD28-203ENST00000439830 TONSLQ96HA7 1378 aa36.01■■■■□ 3.35
ANKRD28-203ENST00000439830 DEFB132Q7Z7B7 95 aa35.99■■■■□ 3.35
ANKRD28-203ENST00000439830 GCP02774 474 aa35.98■■■■□ 3.35
ANKRD28-203ENST00000439830 EVA1CP58658 441 aa35.97■■■■□ 3.35
ANKRD28-203ENST00000439830 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.97■■■■□ 3.35
ANKRD28-203ENST00000439830 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.97■■■■□ 3.35
ANKRD28-203ENST00000439830 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
ANKRD28-203ENST00000439830 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa35.95■■■■□ 3.35
ANKRD28-203ENST00000439830 NLRP6P59044 892 aa35.93■■■■□ 3.34
ANKRD28-203ENST00000439830 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
ANKRD28-203ENST00000439830 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.92■■■■□ 3.34
ANKRD28-203ENST00000439830 USP35Q9P2H5 1018 aa35.92■■■■□ 3.34
ANKRD28-203ENST00000439830 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
ANKRD28-203ENST00000439830 COL18A1P39060 1754 aa35.89■■■■□ 3.34
ANKRD28-203ENST00000439830 BAG6P46379 1132 aa35.89■■■■□ 3.34
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM182BQ5T319 152 aa35.89■■■■□ 3.34
ANKRD28-203ENST00000439830 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
ANKRD28-203ENST00000439830 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.34
ANKRD28-203ENST00000439830 BARGINQ6ZT62 677 aa35.88■■■■□ 3.33
ANKRD28-203ENST00000439830 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
ANKRD28-203ENST00000439830 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
ANKRD28-203ENST00000439830 RGPD5Q99666 1765 aa35.86■■■■□ 3.33
ANKRD28-203ENST00000439830 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.85■■■■□ 3.33
ANKRD28-203ENST00000439830 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.85■■■■□ 3.33
ANKRD28-203ENST00000439830 TCP11L2Q8N4U5 519 aa35.85■■■■□ 3.33
ANKRD28-203ENST00000439830 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.85■■■■□ 3.33
ANKRD28-203ENST00000439830 WNK3Q9BYP7 1800 aa35.84■■■■□ 3.33
ANKRD28-203ENST00000439830 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.83■■■■□ 3.33
ANKRD28-203ENST00000439830 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
ANKRD28-203ENST00000439830 CRB1P82279 1406 aa35.82■■■■□ 3.32
ANKRD28-203ENST00000439830 USP54Q70EL1 1684 aa35.81■■■■□ 3.32
ANKRD28-203ENST00000439830 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
ANKRD28-203ENST00000439830 DISP2A7MBM2 1401 aa35.8■■■■□ 3.32
ANKRD28-203ENST00000439830 FAM196AQ6ZSG2 479 aa35.79■■■■□ 3.32
ANKRD28-203ENST00000439830 PDE3BQ13370 1112 aa35.77■■■■□ 3.32
ANKRD28-203ENST00000439830 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.77■■■■□ 3.32
ANKRD28-203ENST00000439830 NFAT5O94916 1531 aa35.77■■■■□ 3.32
ANKRD28-203ENST00000439830 LRRC37A3O60309 1634 aa35.75■■■■□ 3.31
ANKRD28-203ENST00000439830 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.75■■■■□ 3.31
ANKRD28-203ENST00000439830 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
ANKRD28-203ENST00000439830 LTN1O94822 1766 aa35.72■■■■□ 3.31
ANKRD28-203ENST00000439830 ABCC6O95255 1503 aa35.72■■■■□ 3.31
ANKRD28-203ENST00000439830 TRIM37O94972 964 aa35.71■■■■□ 3.31
ANKRD28-203ENST00000439830 SOX12O15370 315 aa35.7■■■■□ 3.31
ANKRD28-203ENST00000439830 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.7■■■■□ 3.31
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