RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424161.5

TTC28-AS1-204, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 556 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TTC21AQ8NDW8 1320 aa18.45■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.44■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa18.44■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TNS3Q68CZ2 1445 aa18.42■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PHLPP1O60346 1717 aa18.42■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CGNL1Q0VF96 1302 aa18.42■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NSD2O96028 1365 aa18.41■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.41■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ALS2Q96Q42 1657 aa18.41■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa18.4■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIF20BQ96Q89 1820 aa18.39■□□□□ 0.54
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PIK3C2AO00443 1686 aa18.39■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ARHGEF10O15013 1369 aa18.39■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP54Q70EL1 1684 aa18.38■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FYB1O15117 783 aa18.37■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FBXO41Q8TF61 875 aa18.37■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP31Q70CQ4 1352 aa18.37■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa18.36■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 OVOS2Q6IE36 1432 aa18.36■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NME9Q86XW9 330 aa18.36■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ABTB2Q8N961 1025 aa18.36■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa18.35■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NLRP13Q86W25 1043 aa18.34■□□□□ 0.53
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NLRP6P59044 892 aa18.33■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.33■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 COG3Q96JB2 828 aa18.33■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GGNBP2Q9H3C7 697 aa18.33■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 USP19O94966 1318 aa18.32■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PNPLA6Q8IY17 1366 aa18.31■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HSPA1LP34931 641 aa18.31■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SHPRHQ149N8 1683 aa18.31■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SLIT3O75094 1523 aa18.3■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZRANB1Q9UGI0 708 aa18.3■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 JCADQ9P266 1359 aa18.3■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NUTM2GQ5VZR2 741 aa18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MORC1Q86VD1 984 aa18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa18.29■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PARD3Q8TEW0 1356 aa18.28■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KCNH5Q8NCM2 988 aa18.27■□□□□ 0.52
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ABCA3Q99758 1704 aa18.26■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RALBP1Q15311 655 aa18.26■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NFAT5O94916 1531 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ANP32CO43423 234 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 GCP02774 474 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AATKQ6ZMQ8 1374 aa18.25■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa18.23■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CABLES1Q8TDN4 633 aa18.22■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CPDO75976 1380 aa18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SOX12O15370 315 aa18.19■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PLEKHG5O94827 1062 aa18.19■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ARHGEF25Q86VW2 580 aa18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ABCC6O95255 1503 aa18.18■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RTL1A6NKG5 1358 aa18.17■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PPP2R1AP30153 589 aa18.17■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 POLKQ9UBT6 870 aa18.17■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MAP3K19Q56UN5 1328 aa18.17■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LTN1O94822 1766 aa18.17■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FBLN1P23142 703 aa18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 KIAA0232Q92628 1395 aa18.16■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.5
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PRDM11Q9NQV5 511 aa18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 FLT4P35916 1363 aa18.14■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LRP6O75581 1613 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 PEAK1Q9H792 1746 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 AMPHP49418 695 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 MTHFSP49914 203 aa18.13■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 LMO7Q8WWI1 1683 aa18.12■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 COL18A1P39060 1754 aa18.12■□□□□ 0.49
TTC28-AS1-204ENST00000424161 HOXC9P31274 260 aa18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms