RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 ITSN1Q15811 1721 aa29.74■■■□□ 2.35
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC24A1O60721 1099 aa29.73■■■□□ 2.35
SH3BP4-204ENST00000416021 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.73■■■□□ 2.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ABTB2Q8N961 1025 aa29.72■■■□□ 2.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
SH3BP4-204ENST00000416021 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.72■■■□□ 2.35
SH3BP4-204ENST00000416021 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.71■■■□□ 2.35
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
SH3BP4-204ENST00000416021 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM83GA6ND36 823 aa29.69■■■□□ 2.34
SH3BP4-204ENST00000416021 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
SH3BP4-204ENST00000416021 USP47Q96K76 1375 aa29.68■■■□□ 2.34
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
SH3BP4-204ENST00000416021 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
SH3BP4-204ENST00000416021 TMC1Q8TDI8 760 aa29.67■■■□□ 2.34
SH3BP4-204ENST00000416021 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.65■■■□□ 2.34
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.65■■■□□ 2.34
SH3BP4-204ENST00000416021 ALS2Q96Q42 1657 aa29.64■■■□□ 2.34
SH3BP4-204ENST00000416021 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.64■■■□□ 2.34
SH3BP4-204ENST00000416021 NLRP13Q86W25 1043 aa29.64■■■□□ 2.34
SH3BP4-204ENST00000416021 USP6P35125 1406 aa29.63■■■□□ 2.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TMF1P82094 1093 aa29.61■■■□□ 2.33
SH3BP4-204ENST00000416021 NLRP6P59044 892 aa29.6■■■□□ 2.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SLIT2O94813 1529 aa29.6■■■□□ 2.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.59■■■□□ 2.33
SH3BP4-204ENST00000416021 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SH3BP4-204ENST00000416021 SSH2Q76I76 1423 aa29.59■■■□□ 2.33
SH3BP4-204ENST00000416021 ATRNO75882 1429 aa29.58■■■□□ 2.33
SH3BP4-204ENST00000416021 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
SH3BP4-204ENST00000416021 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.57■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 GCP02774 474 aa29.56■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 BTG4Q9NY30 223 aa29.56■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 USP19O94966 1318 aa29.54■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.53■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CHRNA2Q15822 529 aa29.53■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA0232Q92628 1395 aa29.52■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 VPS72Q15906 364 aa29.52■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 CDCA8Q53HL2 280 aa29.52■■■□□ 2.32
SH3BP4-204ENST00000416021 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP29.52■■■□□ 2.321e-8■■□□□ 14.2
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.5■■■□□ 2.31
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
SH3BP4-204ENST00000416021 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.48■■■□□ 2.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCA3Q99758 1704 aa29.48■■■□□ 2.31
SH3BP4-204ENST00000416021 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.47■■■□□ 2.31
SH3BP4-204ENST00000416021 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
SH3BP4-204ENST00000416021 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.45■■■□□ 2.31
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS12O14924 1447 aa29.45■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1W2PP64 1363 aa29.44■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 CPDO75976 1380 aa29.43■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 NME9Q86XW9 330 aa29.43■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.43■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.42■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 EVA1CP58658 441 aa29.42■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB7CA1YPR0 619 aa29.41■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 STRN4Q9NRL3 753 aa29.41■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 SOX12O15370 315 aa29.4■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAP12Q02952 1782 aa29.39■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
SH3BP4-204ENST00000416021 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 USP31Q70CQ4 1352 aa29.38■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 PIK3C2AO00443 1686 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.35■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 SLIT3O75094 1523 aa29.35■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.34■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 GLI3P10071 1580 aa29.33■■■□□ 2.29
SH3BP4-204ENST00000416021 AATKQ6ZMQ8 1374 aa29.32■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.31■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.31■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.31■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.3■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0G2JS52 829 aa29.28■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 MYT1Q01538 1121 aa29.28■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 COG3Q96JB2 828 aa29.28■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 CARD14Q9BXL6 1004 aa29.28■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 USP35Q9P2H5 1018 aa29.28■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 FYB1O15117 783 aa29.27■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 NRAPQ86VF7 1730 aa29.27■■■□□ 2.28
SH3BP4-204ENST00000416021 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
SH3BP4-204ENST00000416021 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.23■■■□□ 2.27
SH3BP4-204ENST00000416021 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.23■■■□□ 2.27
SH3BP4-204ENST00000416021 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms