RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000408919.7

SH3BP5-203, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-203ENST00000408919 FYB1O15117 783 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 PIK3C2AO00443 1686 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 NME9Q86XW9 330 aa24.37■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 MIER1Q8N108 512 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 ANP32CO43423 234 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 TOM1O60784 492 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 PXDNQ92626 1479 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.35■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SH3BP5-203ENST00000408919 NSD2O96028 1365 aa24.33■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 ALS2Q96Q42 1657 aa24.32■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 PIP4K2BP78356 416 aa24.31■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 USP54Q70EL1 1684 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 ABTB2Q8N961 1025 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 RALBP1Q15311 655 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 MORC1Q86VD1 984 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP5-203ENST00000408919 SBNO1A3KN83 1393 aa24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 USP31Q70CQ4 1352 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.25■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 NLRP6P59044 892 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 COG3Q96JB2 828 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 PHLPP1O60346 1717 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.24■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 FBLN1P23142 703 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-203ENST00000408919 PPP2R1AP30153 589 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-203ENST00000408919 CCDC184Q52MB2 194 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-203ENST00000408919 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-203ENST00000408919 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-203ENST00000408919 PLEKHG5O94827 1062 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5-203ENST00000408919 NLRP13Q86W25 1043 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5-203ENST00000408919 SOX12O15370 315 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5-203ENST00000408919 SLIT3O75094 1523 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-203ENST00000408919 ARHGEF10O15013 1369 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-203ENST00000408919 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5-203ENST00000408919 USP19O94966 1318 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5-203ENST00000408919 NFAT5O94916 1531 aa24.14■■□□□ 1.45
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SH3BP5-203ENST00000408919 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 ABCA3Q99758 1704 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 LTN1O94822 1766 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 CCER2I3L3R5 266 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 MTHFSP49914 203 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 POLKQ9UBT6 870 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 PEAK1Q9H792 1746 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 GCP02774 474 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 MRS2Q9HD23 443 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP5-203ENST00000408919 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
SH3BP5-203ENST00000408919 MAP3K19Q56UN5 1328 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP5-203ENST00000408919 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP5-203ENST00000408919 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP5-203ENST00000408919 HSPA1LP34931 641 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP5-203ENST00000408919 SHPRHQ149N8 1683 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP5-203ENST00000408919 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP5-203ENST00000408919 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP5-203ENST00000408919 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SH3BP5-203ENST00000408919 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 RGPD5Q99666 1765 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 COL18A1P39060 1754 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 KIAA0232Q92628 1395 aa23.98■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 INSRP06213 1382 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 FLT4P35916 1363 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 AMPHP49418 695 aa23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 HOXC9P31274 260 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 JCADQ9P266 1359 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 CFAP53Q96M91 514 aa23.96■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 CPDO75976 1380 aa23.95■■□□□ 1.43
SH3BP5-203ENST00000408919 KIF24Q5T7B8 1368 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP5-203ENST00000408919 RTL1A6NKG5 1358 aa23.94■■□□□ 1.42
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