RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400376.2

TTYH3-202, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TTYH3, Length 560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-202ENST00000400376 SOCS7O14512 581 aa25■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.99■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 USP21Q9UK80 565 aa24.99■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 ABTB2Q8N961 1025 aa24.98■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.97■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.97■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 ITSN1Q15811 1721 aa24.96■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 FAM83GA6ND36 823 aa24.96■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 RXRBP28702 533 aa24.96■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 TMC1Q8TDI8 760 aa24.96■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
TTYH3-202ENST00000400376 USP6P35125 1406 aa24.94■■□□□ 1.58
TTYH3-202ENST00000400376 TMF1P82094 1093 aa24.93■■□□□ 1.58
TTYH3-202ENST00000400376 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
TTYH3-202ENST00000400376 SSH2Q76I76 1423 aa24.92■■□□□ 1.58
TTYH3-202ENST00000400376 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.91■■□□□ 1.58
TTYH3-202ENST00000400376 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TTYH3-202ENST00000400376 NLRP13Q86W25 1043 aa24.91■■□□□ 1.58
TTYH3-202ENST00000400376 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
TTYH3-202ENST00000400376 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.9■■□□□ 1.58
TTYH3-202ENST00000400376 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.9■■□□□ 1.58
TTYH3-202ENST00000400376 ALS2Q96Q42 1657 aa24.9■■□□□ 1.58
TTYH3-202ENST00000400376 NLRP6P59044 892 aa24.89■■□□□ 1.58
TTYH3-202ENST00000400376 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 SLIT2O94813 1529 aa24.86■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 GCP02774 474 aa24.86■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.86■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 USP19O94966 1318 aa24.86■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 CDCA8Q53HL2 280 aa24.85■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 ATRNO75882 1429 aa24.85■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.84■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.84■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.84■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 BTG4Q9NY30 223 aa24.83■■□□□ 1.57
TTYH3-202ENST00000400376 KIAA0232Q92628 1395 aa24.82■■□□□ 1.56
TTYH3-202ENST00000400376 CHRNA2Q15822 529 aa24.82■■□□□ 1.56
TTYH3-202ENST00000400376 VPS72Q15906 364 aa24.8■■□□□ 1.56
TTYH3-202ENST00000400376 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.8■■□□□ 1.56
TTYH3-202ENST00000400376 A0A1W2PP64 1363 aa24.8■■□□□ 1.56
TTYH3-202ENST00000400376 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.8■■□□□ 1.56
TTYH3-202ENST00000400376 NME9Q86XW9 330 aa24.78■■□□□ 1.56
TTYH3-202ENST00000400376 CPDO75976 1380 aa24.76■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 ABCA3Q99758 1704 aa24.75■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.74■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 USP31Q70CQ4 1352 aa24.73■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.72■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 SOX12O15370 315 aa24.72■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.72■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 RGS12O14924 1447 aa24.71■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.71■■□□□ 1.55
TTYH3-202ENST00000400376 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 EVA1CP58658 441 aa24.7■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.7■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 STRN4Q9NRL3 753 aa24.7■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 AKAP12Q02952 1782 aa24.7■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.69■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 SLIT3O75094 1523 aa24.68■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.68■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 PIK3C2AO00443 1686 aa24.68■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.67■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.67■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.67■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.67■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.66■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 FYB1O15117 783 aa24.65■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.65■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.64■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TTYH3-202ENST00000400376 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.64■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.64■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 COG3Q96JB2 828 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 GLI3P10071 1580 aa24.63■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.62■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.532e-12■■■■□ 21.2
TTYH3-202ENST00000400376 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.6■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 USP35Q9P2H5 1018 aa24.59■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.59■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.59■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 FBLN1P23142 703 aa24.58■■□□□ 1.53
TTYH3-202ENST00000400376 PANK3Q9H999 370 aa24.57■■□□□ 1.52
TTYH3-202ENST00000400376 NRAPQ86VF7 1730 aa24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms