RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376085.3

LRRC38-201, Transcript of leucine rich repeat containing 38, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC38, Length 2,209 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38-201ENST00000376085 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.62■■□□□ 1.21
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LRRC38-201ENST00000376085 ZNF521Q96K83 1311 aa22.61■■□□□ 1.21
LRRC38-201ENST00000376085 NEUROD2Q15784 382 aa22.61■■□□□ 1.21
LRRC38-201ENST00000376085 CFAP53Q96M91 514 aa22.61■■□□□ 1.21
LRRC38-201ENST00000376085 PIK3R4Q99570 1358 aa22.61■■□□□ 1.21
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LRRC38-201ENST00000376085 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
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LRRC38-201ENST00000376085 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.6■■□□□ 1.21
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LRRC38-201ENST00000376085 AKAP12Q02952 1782 aa22.59■■□□□ 1.21
LRRC38-201ENST00000376085 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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LRRC38-201ENST00000376085 SOX12O15370 315 aa22.56■■□□□ 1.2
LRRC38-201ENST00000376085 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.56■■□□□ 1.2
LRRC38-201ENST00000376085 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.56■■□□□ 1.2
LRRC38-201ENST00000376085 USP6P35125 1406 aa22.56■■□□□ 1.2
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LRRC38-201ENST00000376085 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.54■■□□□ 1.2
LRRC38-201ENST00000376085 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.53■■□□□ 1.2
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LRRC38-201ENST00000376085 MYT1Q01538 1121 aa22.53■■□□□ 1.2
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LRRC38-201ENST00000376085 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.53■■□□□ 1.2
LRRC38-201ENST00000376085 SSH2Q76I76 1423 aa22.52■■□□□ 1.2
LRRC38-201ENST00000376085 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.52■■□□□ 1.2
LRRC38-201ENST00000376085 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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LRRC38-201ENST00000376085 WWC1Q8IX03 1113 aa22.51■■□□□ 1.19
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LRRC38-201ENST00000376085 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.5■■□□□ 1.19
LRRC38-201ENST00000376085 C14orf37Q86TY3 774 aa22.49■■□□□ 1.19
LRRC38-201ENST00000376085 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.49■■□□□ 1.19
LRRC38-201ENST00000376085 PLIN1O60240 522 aa22.48■■□□□ 1.19
LRRC38-201ENST00000376085 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.48■■□□□ 1.19
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LRRC38-201ENST00000376085 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.46■■□□□ 1.19
LRRC38-201ENST00000376085 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.46■■□□□ 1.19
LRRC38-201ENST00000376085 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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LRRC38-201ENST00000376085 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.45■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 IL13P35225 146 aa22.45■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.44■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 AATKQ6ZMQ8 1374 aa22.44■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.44■■□□□ 1.18
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LRRC38-201ENST00000376085 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
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LRRC38-201ENST00000376085 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.42■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.41■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.41■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.41■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 PRKAR2BP31323 418 aa22.4■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 PLEKHG5O94827 1062 aa22.39■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 NLRP6P59044 892 aa22.39■■□□□ 1.18
LRRC38-201ENST00000376085 PIK3C2AO00443 1686 aa22.39■■□□□ 1.17
LRRC38-201ENST00000376085 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.38■■□□□ 1.17
LRRC38-201ENST00000376085 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.38■■□□□ 1.17
LRRC38-201ENST00000376085 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
LRRC38-201ENST00000376085 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.38■■□□□ 1.17
LRRC38-201ENST00000376085 USP31Q70CQ4 1352 aa22.38■■□□□ 1.17
LRRC38-201ENST00000376085 NWD1Q149M9 1564 aa22.37■■□□□ 1.17
LRRC38-201ENST00000376085 PEAK1Q9H792 1746 aa22.37■■□□□ 1.17
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LRRC38-201ENST00000376085 MAP3K19Q56UN5 1328 aa22.37■■□□□ 1.17
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LRRC38-201ENST00000376085 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.37■■□□□ 1.17
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LRRC38-201ENST00000376085 RIPK4P57078 832 aa22.34■■□□□ 1.17
LRRC38-201ENST00000376085 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
LRRC38-201ENST00000376085 BCAR3O75815 825 aa22.33■■□□□ 1.17
LRRC38-201ENST00000376085 PSME1Q06323 249 aa22.33■■□□□ 1.16
LRRC38-201ENST00000376085 CCDC27Q2M243 656 aa22.32■■□□□ 1.16
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LRRC38-201ENST00000376085 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
LRRC38-201ENST00000376085 NGEFQ8N5V2 710 aa22.31■■□□□ 1.16
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