RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.55□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 TTC5Q8N0Z6 440 aa12.55□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa12.55□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 FAM161AQ3B820 660 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 KCNJ4P48050 445 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 FYB1O15117 783 aa12.54□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1W2PP64 1363 aa12.53□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 CEP152O94986 1710 aa12.53□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 DCTN1Q14203 1278 aa12.53□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 NFE2L2Q16236 605 aa12.53□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 C20orf194Q5TEA3 1177 aa12.53□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 C1orf115Q9H7X2 142 aa12.52□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 USHBP1Q8N6Y0 703 aa12.52□□□□□ -0.4
TTPAL-202ENST00000372904 PTPRTO14522 1441 aa12.52□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 ABCC3O15438 1527 aa12.52□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 PHF8Q9UPP1 1060 aa12.52□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 E9PCH4 1651 aa12.52□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 MCM10Q7L590 875 aa12.51□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.51□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 NCLP19338 710 aaKnown RBP12.51□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 USP35Q9P2H5 1018 aa12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 EFCAB6Q5THR3 1501 aa12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 MCCP23508 829 aa12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 DUSP27Q5VZP5 1158 aa12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 STRN4Q9NRL3 753 aa12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 FOXO3O43524 673 aa12.49□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 SLC4A3P48751 1232 aa12.49□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 PDE3AQ14432 1141 aa12.49□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.49□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 MYOM2P54296 1465 aa12.48□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 LNPKQ9C0E8 428 aa12.48□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 FANCIQ9NVI1 1328 aa12.48□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 CFAP44Q96MT7 982 aa12.48□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 GOLGA6L22H0YM25 854 aa12.48□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 SLC4A2P04920 1241 aa12.47□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 BCORL1Q5H9F3 1711 aa12.47□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa12.47□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 CCDC30Q5VVM6 783 aa12.47□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 PIK3C2GO75747 1445 aa12.46□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 RILPL2Q969X0 211 aa12.46□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 GPATCH3Q96I76 525 aa12.46□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa12.46□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 RARSP54136 660 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 TAF7LQ5H9L4 462 aa12.46□□□□□ -0.41
TTPAL-202ENST00000372904 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.46□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa12.46□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 ZNF428Q96B54 188 aa12.46□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.46□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 MAGI2Q86UL8 1455 aa12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 FAM83GA6ND36 823 aa12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 ERVK-7P63135 1459 aa12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 FGD1P98174 961 aa12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 SKAP1Q86WV1 359 aa12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa12.45□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.44□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 HDAC5Q9UQL6 1122 aa12.44□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 NEXNQ0ZGT2 675 aa12.44□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa12.44□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 KCNA6P17658 529 aa12.44□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 IFT57Q9NWB7 429 aa12.44□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 POLKQ9UBT6 870 aa12.43□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 SYNMO15061 1565 aa12.43□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.43□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 RIC3Q7Z5B4 369 aa12.43□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM2Q9UHN6 1383 aa12.43□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 DDX58O95786 925 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa12.43□□□□□ -0.42
TTPAL-202ENST00000372904 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms