RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372339.3

IPO13-201, Transcript of importin 13, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene IPO13, Length 1,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO13-201ENST00000372339 BRWD3Q6RI45 1802 aa29.29■■■□□ 2.28
IPO13-201ENST00000372339 ITSN1Q15811 1721 aa29.29■■■□□ 2.28
IPO13-201ENST00000372339 CCDC61Q9Y6R9 512 aa29.28■■■□□ 2.28
IPO13-201ENST00000372339 ACEP12821 1306 aa29.27■■■□□ 2.28
IPO13-201ENST00000372339 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.26■■■□□ 2.28
IPO13-201ENST00000372339 A0A0G2JS52 829 aa29.26■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 MYT1Q01538 1121 aa29.26■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.26■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 KRT27Q7Z3Y8 459 aa29.26■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.26■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.25■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 PLEKHG3A1L390 1219 aa29.24■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 NRAPQ86VF7 1730 aa29.24■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.24■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 ZRANB1Q9UGI0 708 aa29.24■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.23■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 SIN3AQ96ST3 1273 aa29.22■■■□□ 2.27
IPO13-201ENST00000372339 CHRNA2Q15822 529 aa29.2■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 DEFB132Q7Z7B7 95 aa29.2■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 KIAA0232Q92628 1395 aa29.2■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.2■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa29.2■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa29.2■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 CABP2Q9NPB3 220 aa29.19■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 NEUROD1Q13562 356 aa29.17■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 ABTB2Q8N961 1025 aa29.16■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa29.14■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 STRN4Q9NRL3 753 aa29.14■■■□□ 2.26
IPO13-201ENST00000372339 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
IPO13-201ENST00000372339 FAM182BQ5T319 152 aa29.1■■■□□ 2.25
IPO13-201ENST00000372339 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa29.1■■■□□ 2.25
IPO13-201ENST00000372339 QRICH2Q9H0J4 1663 aa29.09■■■□□ 2.25
IPO13-201ENST00000372339 CABP1Q9NZU7 370 aa29.09■■■□□ 2.25
IPO13-201ENST00000372339 EVA1CP58658 441 aa29.07■■■□□ 2.24
IPO13-201ENST00000372339 NLRP13Q86W25 1043 aa29.07■■■□□ 2.24
IPO13-201ENST00000372339 USP19O94966 1318 aa29.06■■■□□ 2.24
IPO13-201ENST00000372339 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
IPO13-201ENST00000372339 EVC2Q86UK5 1308 aa29.04■■■□□ 2.24
IPO13-201ENST00000372339 USP35Q9P2H5 1018 aa29.04■■■□□ 2.24
IPO13-201ENST00000372339 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.04■■■□□ 2.24
IPO13-201ENST00000372339 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.04■■■□□ 2.24
IPO13-201ENST00000372339 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa29.03■■■□□ 2.24
IPO13-201ENST00000372339 GCP02774 474 aa29.03■■■□□ 2.24
IPO13-201ENST00000372339 BAG6P46379 1132 aa29.03■■■□□ 2.24
IPO13-201ENST00000372339 CPDO75976 1380 aa29.02■■■□□ 2.24
IPO13-201ENST00000372339 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.01■■■□□ 2.23
IPO13-201ENST00000372339 SSH2Q76I76 1423 aa29.01■■■□□ 2.23
IPO13-201ENST00000372339 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
IPO13-201ENST00000372339 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
IPO13-201ENST00000372339 USP6P35125 1406 aa29■■■□□ 2.23
IPO13-201ENST00000372339 NLRP6P59044 892 aa28.99■■■□□ 2.23
IPO13-201ENST00000372339 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.96■■■□□ 2.23
IPO13-201ENST00000372339 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
IPO13-201ENST00000372339 BARGINQ6ZT62 677 aa28.96■■■□□ 2.23
IPO13-201ENST00000372339 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.94■■■□□ 2.22
IPO13-201ENST00000372339 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.94■■■□□ 2.22
IPO13-201ENST00000372339 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.92■■■□□ 2.22
IPO13-201ENST00000372339 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.91■■■□□ 2.22
IPO13-201ENST00000372339 TRIM37O94972 964 aa28.91■■■□□ 2.22
IPO13-201ENST00000372339 PDE3BQ13370 1112 aa28.91■■■□□ 2.22
IPO13-201ENST00000372339 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
IPO13-201ENST00000372339 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
IPO13-201ENST00000372339 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
IPO13-201ENST00000372339 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
IPO13-201ENST00000372339 SLIT3O75094 1523 aa28.88■■■□□ 2.21
IPO13-201ENST00000372339 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.88■■■□□ 2.21
IPO13-201ENST00000372339 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.87■■■□□ 2.21
IPO13-201ENST00000372339 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.86■■■□□ 2.21
IPO13-201ENST00000372339 PIK3C2AO00443 1686 aa28.86■■■□□ 2.21
IPO13-201ENST00000372339 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
IPO13-201ENST00000372339 DISP2A7MBM2 1401 aa28.85■■■□□ 2.21
IPO13-201ENST00000372339 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
IPO13-201ENST00000372339 APBA3O96018 575 aa28.83■■■□□ 2.21
IPO13-201ENST00000372339 CRB1P82279 1406 aa28.83■■■□□ 2.21
IPO13-201ENST00000372339 SOX12O15370 315 aa28.82■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.81■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.81■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.81■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 TONSLQ96HA7 1378 aa28.8■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 AKAP12Q02952 1782 aa28.8■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.79■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.79■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.79■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.79■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 COL18A1P39060 1754 aa28.77■■■□□ 2.2
IPO13-201ENST00000372339 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
IPO13-201ENST00000372339 TMC1Q8TDI8 760 aa28.75■■■□□ 2.19
IPO13-201ENST00000372339 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.74■■■□□ 2.19
IPO13-201ENST00000372339 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms