RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 SSH2Q76I76 1423 aa40.61■■■■■ 4.09
ECHS1-201ENST00000368547 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
ECHS1-201ENST00000368547 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
ECHS1-201ENST00000368547 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.09
ECHS1-201ENST00000368547 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40.57■■■■■ 4.09
ECHS1-201ENST00000368547 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa40.57■■■■■ 4.08
ECHS1-201ENST00000368547 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
ECHS1-201ENST00000368547 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
ECHS1-201ENST00000368547 KNSTRNQ9Y448 316 aa40.55■■■■■ 4.08
ECHS1-201ENST00000368547 SBNO1A3KN83 1393 aa40.53■■■■■ 4.08
ECHS1-201ENST00000368547 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
ECHS1-201ENST00000368547 TTC21AQ8NDW8 1320 aa40.51■■■■■ 4.08
ECHS1-201ENST00000368547 ALS2Q96Q42 1657 aa40.51■■■■■ 4.07
ECHS1-201ENST00000368547 KIF20BQ96Q89 1820 aa40.5■■■■■ 4.07
ECHS1-201ENST00000368547 PIK3C2AO00443 1686 aa40.49■■■■■ 4.07
ECHS1-201ENST00000368547 TNS3Q68CZ2 1445 aa40.49■■■■■ 4.07
ECHS1-201ENST00000368547 CGNL1Q0VF96 1302 aa40.48■■■■■ 4.07
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa40.48■■■■■ 4.07
ECHS1-201ENST00000368547 NME9Q86XW9 330 aa40.46■■■■■ 4.07
ECHS1-201ENST00000368547 LMOD2Q6P5Q4 547 aa40.45■■■■■ 4.07
ECHS1-201ENST00000368547 ABTB2Q8N961 1025 aa40.45■■■■■ 4.07
ECHS1-201ENST00000368547 FYB1O15117 783 aa40.44■■■■■ 4.06
ECHS1-201ENST00000368547 FBXO41Q8TF61 875 aa40.44■■■■■ 4.06
ECHS1-201ENST00000368547 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
ECHS1-201ENST00000368547 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
ECHS1-201ENST00000368547 NUTM2GQ5VZR2 741 aa40.41■■■■■ 4.06
ECHS1-201ENST00000368547 HSPA1LP34931 641 aa40.4■■■■■ 4.06
ECHS1-201ENST00000368547 GGNBP2Q9H3C7 697 aa40.4■■■■■ 4.06
ECHS1-201ENST00000368547 ZRANB1Q9UGI0 708 aa40.4■■■■■ 4.06
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF10O15013 1369 aa40.39■■■■■ 4.06
ECHS1-201ENST00000368547 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa40.37■■■■■ 4.05
ECHS1-201ENST00000368547 NLRP6P59044 892 aa40.37■■■■■ 4.05
ECHS1-201ENST00000368547 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP40.36■■■■■ 4.05
ECHS1-201ENST00000368547 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
ECHS1-201ENST00000368547 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
ECHS1-201ENST00000368547 NSD2O96028 1365 aa40.35■■■■■ 4.05
ECHS1-201ENST00000368547 USP54Q70EL1 1684 aa40.35■■■■■ 4.05
ECHS1-201ENST00000368547 USP31Q70CQ4 1352 aa40.34■■■■■ 4.05
ECHS1-201ENST00000368547 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa40.34■■■■■ 4.05
ECHS1-201ENST00000368547 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa40.32■■■■■ 4.05
ECHS1-201ENST00000368547 OVOS2Q6IE36 1432 aa40.32■■■■■ 4.05
ECHS1-201ENST00000368547 NLRP13Q86W25 1043 aa40.32■■■■■ 4.05
ECHS1-201ENST00000368547 COG3Q96JB2 828 aa40.31■■■■■ 4.04
ECHS1-201ENST00000368547 PNPLA6Q8IY17 1366 aa40.3■■■■■ 4.04
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHG5O94827 1062 aa40.3■■■■■ 4.04
ECHS1-201ENST00000368547 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
ECHS1-201ENST00000368547 SHPRHQ149N8 1683 aa40.27■■■■■ 4.04
ECHS1-201ENST00000368547 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
ECHS1-201ENST00000368547 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa40.26■■■■■ 4.04
ECHS1-201ENST00000368547 MIER1Q8N108 512 aa40.25■■■■■ 4.03
ECHS1-201ENST00000368547 USP19O94966 1318 aa40.24■■■■■ 4.03
ECHS1-201ENST00000368547 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
ECHS1-201ENST00000368547 MORC1Q86VD1 984 aa40.24■■■■■ 4.03
ECHS1-201ENST00000368547 CABLES1Q8TDN4 633 aa40.24■■■■■ 4.03
ECHS1-201ENST00000368547 JCADQ9P266 1359 aa40.23■■■■■ 4.03
ECHS1-201ENST00000368547 ABCA3Q99758 1704 aa40.22■■■■■ 4.03
ECHS1-201ENST00000368547 SLIT3O75094 1523 aa40.21■■■■■ 4.03
ECHS1-201ENST00000368547 SOX12O15370 315 aa40.18■■■■■ 4.02
ECHS1-201ENST00000368547 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
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ECHS1-201ENST00000368547 KCNH5Q8NCM2 988 aa40.13■■■■■ 4.02
ECHS1-201ENST00000368547 NFAT5O94916 1531 aa40.13■■■■■ 4.01
ECHS1-201ENST00000368547 FBLN1P23142 703 aa40.13■■■■■ 4.01
ECHS1-201ENST00000368547 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
ECHS1-201ENST00000368547 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
ECHS1-201ENST00000368547 ANP32CO43423 234 aa40.1■■■■■ 4.01
ECHS1-201ENST00000368547 RALBP1Q15311 655 aa40.09■■■■■ 4.01
ECHS1-201ENST00000368547 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP40.09■■■■■ 4.01
ECHS1-201ENST00000368547 LTN1O94822 1766 aa40.05■■■■■ 4
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ECHS1-201ENST00000368547 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
ECHS1-201ENST00000368547 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
ECHS1-201ENST00000368547 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa40.05■■■■■ 4
ECHS1-201ENST00000368547 AATKQ6ZMQ8 1374 aa40.05■■■■■ 4
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ECHS1-201ENST00000368547 PPP2R1AP30153 589 aa39.99■■■■□ 3.99
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ECHS1-201ENST00000368547 MAP3K19Q56UN5 1328 aa39.99■■■■□ 3.99
ECHS1-201ENST00000368547 POLKQ9UBT6 870 aa39.98■■■■□ 3.99
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB7CA1YPR0 619 aa39.98■■■■□ 3.99
ECHS1-201ENST00000368547 ARHGEF25Q86VW2 580 aa39.98■■■■□ 3.99
ECHS1-201ENST00000368547 CPDO75976 1380 aa39.97■■■■□ 3.99
ECHS1-201ENST00000368547 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa39.97■■■■□ 3.99
ECHS1-201ENST00000368547 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
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ECHS1-201ENST00000368547 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP39.93■■■■□ 3.98
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ECHS1-201ENST00000368547 MTHFSP49914 203 aa39.92■■■■□ 3.98
ECHS1-201ENST00000368547 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
ECHS1-201ENST00000368547 CHRNA2Q15822 529 aa39.91■■■■□ 3.98
ECHS1-201ENST00000368547 AMPHP49418 695 aa39.9■■■■□ 3.98
ECHS1-201ENST00000368547 COL18A1P39060 1754 aa39.89■■■■□ 3.98
ECHS1-201ENST00000368547 FAM83GA6ND36 823 aa39.87■■■■□ 3.97
ECHS1-201ENST00000368547 CCER2I3L3R5 266 aa39.87■■■■□ 3.97
ECHS1-201ENST00000368547 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
ECHS1-201ENST00000368547 RGPD5Q99666 1765 aa39.86■■■■□ 3.97
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