RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354833.7

SERF1A-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1A, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1A-202ENST00000354833 RNF123Q5XPI4 1314 aa32.14■■■□□ 2.74
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SERF1A-202ENST00000354833 NRKQ7Z2Y5 1582 aa32.14■■■□□ 2.74
SERF1A-202ENST00000354833 ANKARQ7Z5J8 1434 aa32.13■■■□□ 2.73
SERF1A-202ENST00000354833 USP6P35125 1406 aa32.12■■■□□ 2.73
SERF1A-202ENST00000354833 RUNDC1Q96C34 613 aa32.12■■■□□ 2.73
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SERF1A-202ENST00000354833 ERICH6BQ5W0A0 696 aa32.11■■■□□ 2.73
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SERF1A-202ENST00000354833 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa32.1■■■□□ 2.73
SERF1A-202ENST00000354833 POLKQ9UBT6 870 aa32.09■■■□□ 2.73
SERF1A-202ENST00000354833 ZRANB1Q9UGI0 708 aa32.09■■■□□ 2.73
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SERF1A-202ENST00000354833 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP32.07■■■□□ 2.72
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SERF1A-202ENST00000354833 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.06■■■□□ 2.72
SERF1A-202ENST00000354833 SSH2Q76I76 1423 aa32.06■■■□□ 2.72
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SERF1A-202ENST00000354833 FBLN1P23142 703 aa32.03■■■□□ 2.72
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SERF1A-202ENST00000354833 NWD1Q149M9 1564 aa32.02■■■□□ 2.72
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SERF1A-202ENST00000354833 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.74■■■□□ 2.67
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SERF1A-202ENST00000354833 MYH16Q9H6N6 1097 aa31.69■■■□□ 2.66
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SERF1A-202ENST00000354833 PLIN1O60240 522 aa31.68■■■□□ 2.66
SERF1A-202ENST00000354833 ORAI2Q96SN7 254 aa31.68■■■□□ 2.66
SERF1A-202ENST00000354833 C1orf167Q5SNV9 1468 aa31.66■■■□□ 2.66
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SERF1A-202ENST00000354833 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa31.66■■■□□ 2.66
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