RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
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SHQ1-201ENST00000325599 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
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SHQ1-201ENST00000325599 AGLP35573 1532 aa20.9■□□□□ 0.94
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SHQ1-201ENST00000325599 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.89■□□□□ 0.93
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SHQ1-201ENST00000325599 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.87■□□□□ 0.93
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SHQ1-201ENST00000325599 TSPYL6Q8N831 410 aa20.76■□□□□ 0.91
SHQ1-201ENST00000325599 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.76■□□□□ 0.91
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SHQ1-201ENST00000325599 KIF16BQ96L93 1317 aa20.75■□□□□ 0.91
SHQ1-201ENST00000325599 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.74■□□□□ 0.91
SHQ1-201ENST00000325599 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
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SHQ1-201ENST00000325599 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.73■□□□□ 0.91
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