RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.66■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 SSH2Q76I76 1423 aa26.66■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC184Q52MB2 194 aa26.66■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 PPP2R1AP30153 589 aa26.64■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.64■■□□□ 1.86
CCDC71-201ENST00000321895 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.64■■□□□ 1.85
CCDC71-201ENST00000321895 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.63■■□□□ 1.85
CCDC71-201ENST00000321895 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.62■■□□□ 1.85
CCDC71-201ENST00000321895 ORAI2Q96SN7 254 aa26.61■■□□□ 1.85
CCDC71-201ENST00000321895 NME9Q86XW9 330 aa26.59■■□□□ 1.85
CCDC71-201ENST00000321895 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 COG3Q96JB2 828 aa26.55■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 PIK3C2AO00443 1686 aa26.55■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.54■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.54■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 PSME1Q06323 249 aa26.53■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 USP54Q70EL1 1684 aa26.53■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 FOXO3O43524 673 aa26.52■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 USP31Q70CQ4 1352 aa26.52■■□□□ 1.84
CCDC71-201ENST00000321895 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 SLAIN2Q9P270 581 aa26.51■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.51■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.48■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.47■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 NPHP3Q7Z494 1330 aa26.47■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 MTHFSP49914 203 aa26.46■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 BRINP3Q76B58 766 aa26.46■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.46■■□□□ 1.83
CCDC71-201ENST00000321895 ABTB2Q8N961 1025 aa26.45■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 NLRP6P59044 892 aa26.43■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 CFAP53Q96M91 514 aa26.42■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 PXDNQ92626 1479 aa26.41■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 ALS2Q96Q42 1657 aa26.41■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 SBNO1A3KN83 1393 aa26.4■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 POLKQ9UBT6 870 aa26.39■■□□□ 1.82
CCDC71-201ENST00000321895 INSRP06213 1382 aa26.38■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 SHPRHQ149N8 1683 aa26.38■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.38■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 PNPLA6Q8IY17 1366 aa26.38■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 FBLN1P23142 703 aa26.36■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.35■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.35■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.34■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.33■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.33■■□□□ 1.81
CCDC71-201ENST00000321895 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 SLIT3O75094 1523 aa26.32■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 USP19O94966 1318 aa26.31■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 NFAT5O94916 1531 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGEF10O15013 1369 aa26.3■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 PEAK1Q9H792 1746 aa26.29■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.29■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 SOX12O15370 315 aa26.28■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.28■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.27■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 NUDCQ9Y266 331 aa26.27■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CCDC71-201ENST00000321895 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 TOM1O60784 492 aa26.26■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 LTN1O94822 1766 aa26.26■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 FLT4P35916 1363 aa26.24■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.24■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 GCP02774 474 aa26.23■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 RTL1A6NKG5 1358 aa26.22■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 AMPHP49418 695 aa26.2■■□□□ 1.79
CCDC71-201ENST00000321895 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 IL13P35225 146 aa26.18■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.18■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 CERKQ8TCT0 537 aa26.18■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.17■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 HOXC9P31274 260 aa26.16■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.15■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.15■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 PHLPP1O60346 1717 aa26.14■■□□□ 1.78
CCDC71-201ENST00000321895 ABCA3Q99758 1704 aa26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms