RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.98■■■□□ 2.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACEP12821 1306 aa28.97■■■□□ 2.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP6P35125 1406 aa28.97■■■□□ 2.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.95■■■□□ 2.23
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.95■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.94■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NME9Q86XW9 330 aa28.94■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SSH2Q76I76 1423 aa28.93■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.93■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERICH6BQ5W0A0 696 aa28.93■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APAF1O14727 1248 aa28.91■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.91■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUTM2FA1L443 756 aa28.9■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RUNDC1Q96C34 613 aa28.9■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.9■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.9■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 COG3Q96JB2 828 aa28.89■■■□□ 2.22
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.88■■■□□ 2.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.88■■■□□ 2.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLKQ9UBT6 870 aa28.88■■■□□ 2.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.86■■■□□ 2.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA2Q08379 1002 aa28.85■■■□□ 2.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.84■■■□□ 2.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.8■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.8■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP54Q70EL1 1684 aa28.8■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP31Q70CQ4 1352 aa28.79■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.79■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLFN5Q08AF3 891 aa28.78■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.78■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIK3C2AO00443 1686 aa28.78■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC27Q2M243 656 aa28.77■■■□□ 2.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBLN1P23142 703 aa28.76■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.76■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.75■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WWC1Q8IX03 1113 aa28.75■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.75■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 E9PSI1 815 aa28.74■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.72■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FCHSD2O94868 740 aa28.7■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.7■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL13P35225 146 aa28.69■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.69■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.69■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR63Q8IWG1 891 aa28.68■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PEAK1Q9H792 1746 aa28.68■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.67■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.66■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.66■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.65■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C14orf37Q86TY3 774 aa28.65■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.65■■■□□ 2.18
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEUROD2Q15784 382 aa28.63■■■□□ 2.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STRCQ7RTU9 1775 aa28.62■■■□□ 2.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF1AQ12756 1690 aa28.61■■■□□ 2.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSPA2P54652 639 aa28.61■■■□□ 2.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.61■■■□□ 2.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.6■■■□□ 2.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCCP43146 1447 aa28.6■■■□□ 2.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.58■■■□□ 2.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SBNO1A3KN83 1393 aa28.58■■■□□ 2.17
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRKAR2BP31323 418 aa28.57■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIF24Q5T7B8 1368 aa28.57■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLRP6P59044 892 aa28.57■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.56■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FLT4P35916 1363 aa28.55■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.55■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.55■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM94Q12767 1356 aa28.55■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NEFMP07197 916 aa28.55■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABTB2Q8N961 1025 aa28.54■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IL16Q14005 1332 aa28.53■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.52■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.52■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HMOX1P09601 288 aa28.52■■■□□ 2.16
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIPK4P57078 832 aa28.51■■■□□ 2.15
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSME1Q06323 249 aa28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms