RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA2Q08379 1002 aa35.38■■■■□ 3.25
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HOXD8-201ENST00000313173 HSPA2P54652 639 aa35.36■■■■□ 3.25
HOXD8-201ENST00000313173 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.36■■■■□ 3.25
HOXD8-201ENST00000313173 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.35■■■■□ 3.25
HOXD8-201ENST00000313173 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.35■■■■□ 3.25
HOXD8-201ENST00000313173 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
HOXD8-201ENST00000313173 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
HOXD8-201ENST00000313173 KCNA6P17658 529 aa35.32■■■■□ 3.25
HOXD8-201ENST00000313173 NME9Q86XW9 330 aa35.32■■■■□ 3.25
HOXD8-201ENST00000313173 RRP1P56182 461 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
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HOXD8-201ENST00000313173 SLFN5Q08AF3 891 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXD8-201ENST00000313173 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXD8-201ENST00000313173 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
HOXD8-201ENST00000313173 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP35.3■■■■□ 3.24
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HOXD8-201ENST00000313173 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.27■■■■□ 3.24
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HOXD8-201ENST00000313173 NUTM2FA1L443 756 aa35.26■■■■□ 3.23
HOXD8-201ENST00000313173 POLKQ9UBT6 870 aa35.26■■■■□ 3.23
HOXD8-201ENST00000313173 TCP11L2Q8N4U5 519 aa35.25■■■■□ 3.23
HOXD8-201ENST00000313173 COG3Q96JB2 828 aa35.25■■■■□ 3.23
HOXD8-201ENST00000313173 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.24■■■■□ 3.23
HOXD8-201ENST00000313173 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
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HOXD8-201ENST00000313173 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.23■■■■□ 3.23
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HOXD8-201ENST00000313173 WWC1Q8IX03 1113 aa35.22■■■■□ 3.23
HOXD8-201ENST00000313173 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.22■■■■□ 3.23
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HOXD8-201ENST00000313173 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
HOXD8-201ENST00000313173 SSH2Q76I76 1423 aa35.18■■■■□ 3.22
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC27Q2M243 656 aa35.18■■■■□ 3.22
HOXD8-201ENST00000313173 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
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HOXD8-201ENST00000313173 FBLN1P23142 703 aa35.16■■■■□ 3.22
HOXD8-201ENST00000313173 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa35.16■■■■□ 3.22
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HOXD8-201ENST00000313173 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXD8-201ENST00000313173 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXD8-201ENST00000313173 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
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HOXD8-201ENST00000313173 WDR63Q8IWG1 891 aa35.11■■■■□ 3.21
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HOXD8-201ENST00000313173 NWD1Q149M9 1564 aa35.08■■■■□ 3.21
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HOXD8-201ENST00000313173 USP31Q70CQ4 1352 aa35.06■■■■□ 3.2
HOXD8-201ENST00000313173 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
HOXD8-201ENST00000313173 IL13P35225 146 aa35.03■■■■□ 3.2
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HOXD8-201ENST00000313173 RSPH6AQ9H0K4 717 aa35■■■■□ 3.19
HOXD8-201ENST00000313173 PLIN1O60240 522 aa35■■■■□ 3.19
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HOXD8-201ENST00000313173 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
HOXD8-201ENST00000313173 USP54Q70EL1 1684 aa34.95■■■■□ 3.19
HOXD8-201ENST00000313173 PRKAR2BP31323 418 aa34.94■■■■□ 3.18
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HOXD8-201ENST00000313173 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.94■■■■□ 3.18
HOXD8-201ENST00000313173 C14orf37Q86TY3 774 aa34.93■■■■□ 3.18
HOXD8-201ENST00000313173 MYH16Q9H6N6 1097 aa34.93■■■■□ 3.18
HOXD8-201ENST00000313173 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa34.93■■■■□ 3.18
HOXD8-201ENST00000313173 TRIM35Q9UPQ4 493 aa34.93■■■■□ 3.18
HOXD8-201ENST00000313173 NEFMP07197 916 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXD8-201ENST00000313173 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.91■■■■□ 3.18
HOXD8-201ENST00000313173 RIPK4P57078 832 aa34.9■■■■□ 3.18
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HOXD8-201ENST00000313173 RGPD1P0DJD0 1748 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXD8-201ENST00000313173 BCAR3O75815 825 aa34.83■■■■□ 3.17
HOXD8-201ENST00000313173 SBNO1A3KN83 1393 aa34.82■■■■□ 3.17
HOXD8-201ENST00000313173 MAP3K19Q56UN5 1328 aa34.82■■■■□ 3.16
HOXD8-201ENST00000313173 PHACTR3Q96KR7 559 aa34.81■■■■□ 3.16
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