RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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TSNARE1-201ENST00000307180 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
TSNARE1-201ENST00000307180 PLEKHG5O94827 1062 aa21.4■■□□□ 1.02
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TSNARE1-201ENST00000307180 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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TSNARE1-201ENST00000307180 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.31■■□□□ 1
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TSNARE1-201ENST00000307180 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
TSNARE1-201ENST00000307180 ALS2Q96Q42 1657 aa21.28■■□□□ 1
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TSNARE1-201ENST00000307180 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.27■■□□□ 1
TSNARE1-201ENST00000307180 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.27■■□□□ 1
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TSNARE1-201ENST00000307180 SSH2Q76I76 1423 aa21.26■□□□□ 0.99
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TSNARE1-201ENST00000307180 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
TSNARE1-201ENST00000307180 ADAMTS2O95450 1211 aa21.24■□□□□ 0.99
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TSNARE1-201ENST00000307180 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
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TSNARE1-201ENST00000307180 ABCA3Q99758 1704 aa21.16■□□□□ 0.98
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TSNARE1-201ENST00000307180 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.16■□□□□ 0.98
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TSNARE1-201ENST00000307180 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.14■□□□□ 0.97
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