RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294702.5

GFI1-201, Transcript of growth factor independent 1 transcriptional repressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GFI1, Length 2,784 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1-201ENST00000294702 SLC24A1O60721 1099 aa24.21■■□□□ 1.47
GFI1-201ENST00000294702 TRIM27P14373 513 aa24.21■■□□□ 1.47
GFI1-201ENST00000294702 MYOM1P52179 1685 aa24.21■■□□□ 1.47
GFI1-201ENST00000294702 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.2■■□□□ 1.47
GFI1-201ENST00000294702 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
GFI1-201ENST00000294702 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.2■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 KIF20AO95235 890 aa24.19■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.18■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.17■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.17■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 KIF16BQ96L93 1317 aa24.16■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.16■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.16■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.16■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.16■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 TMEM63CQ9P1W3 806 aa24.16■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 KANK1Q14678 1352 aa24.16■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 FAM177BA6PVY3 158 aa24.15■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 SYCE3A1L190 88 aa24.15■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.15■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.14■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 IQGAP1P46940 1657 aa24.14■■□□□ 1.46
GFI1-201ENST00000294702 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.14■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 RNF214Q8ND24 703 aa24.14■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.14■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 NUCB2P80303 420 aa24.13■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.12■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 CCDC27Q2M243 656 aa24.12■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.11■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 TMEM51Q9NW97 253 aa24.11■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.11■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.11■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 MPNDQ8N594 471 aa24.09■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 JPH4Q96JJ6 628 aa24.09■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 SHPRHQ149N8 1683 aa24.09■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.09■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 SPDYE4A6NLX3 237 aa24.08■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.08■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
GFI1-201ENST00000294702 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 FBLN2P98095 1184 aa24.08■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 IGSF3O75054 1194 aa24.07■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.06■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 ANKRD45Q5TZF3 282 aa24.06■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
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GFI1-201ENST00000294702 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.04■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.04■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.03■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.03■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.03■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 ATP10AO60312 1499 aa24.03■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 KIF3AQ9Y496 699 aa24.03■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 MORC1Q86VD1 984 aa24.02■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 RABEP1Q15276 862 aa24.02■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
GFI1-201ENST00000294702 CEP152O94986 1710 aa24.01■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.01■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 ABCA8O94911 1581 aa24.01■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 UNC13BO14795 1591 aa24■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 ERVK-7P63135 1459 aa23.98■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 MTHFSP49914 203 aa23.98■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.98■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 ZBTB22O15209 634 aa23.97■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 CDC45O75419 566 aa23.97■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 TSPY26PQ9H489 355 aa23.96■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 NOS1P29475 1434 aa23.96■■□□□ 1.43
GFI1-201ENST00000294702 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.95■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 VGLL3A8MV65 326 aa23.94■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.94■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 USP26Q9BXU7 913 aa23.93■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.93■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.93■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
GFI1-201ENST00000294702 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
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