RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 WWC1Q8IX03 1113 aa24.5■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.5■■□□□ 1.51
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USP25-202ENST00000285681 SLC4A2P04920 1241 aa24.49■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 TIAM1Q13009 1591 aa24.49■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 GNAI2P04899 355 aa24.47■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 NUCB2P80303 420 aa24.47■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.47■■□□□ 1.51
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USP25-202ENST00000285681 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.46■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 PRM3Q9NNZ6 103 aa24.46■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 PSMA5P28066 241 aa24.46■■□□□ 1.51
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USP25-202ENST00000285681 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
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USP25-202ENST00000285681 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.44■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 CD109Q6YHK3 1445 aa24.44■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.44■■□□□ 1.5
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USP25-202ENST00000285681 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.43■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 PDE3AQ14432 1141 aa24.43■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 FOSBP53539 338 aa24.43■■□□□ 1.5
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USP25-202ENST00000285681 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
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USP25-202ENST00000285681 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 WDR63Q8IWG1 891 aa24.41■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.41■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.41■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 ARHGEF11O15085 1522 aa24.41■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 HIP1O00291 1037 aa24.41■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.41■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
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USP25-202ENST00000285681 GCC1Q96CN9 775 aa24.4■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.4■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 XBP1P17861 261 aa24.4■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.4■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 IQGAP2Q13576 1575 aa24.4■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
USP25-202ENST00000285681 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.39■■□□□ 1.49
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USP25-202ENST00000285681 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.37■■□□□ 1.49
USP25-202ENST00000285681 FCHSD2O94868 740 aa24.37■■□□□ 1.49
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USP25-202ENST00000285681 MYL6BP14649 208 aa24.35■■□□□ 1.49
USP25-202ENST00000285681 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
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USP25-202ENST00000285681 BCAR3O75815 825 aa24.35■■□□□ 1.49
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USP25-202ENST00000285681 BTBD11A6QL63 1104 aa24.33■■□□□ 1.49
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USP25-202ENST00000285681 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.32■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.32■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 NAIPQ13075 1403 aa24.32■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.32■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.32■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
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USP25-202ENST00000285681 ADGRL1O94910 1474 aa24.31■■□□□ 1.48
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USP25-202ENST00000285681 SIL1Q9H173 461 aa24.31■■□□□ 1.48
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USP25-202ENST00000285681 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.3■■□□□ 1.48
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USP25-202ENST00000285681 NEK4P51957 841 aa24.29■■□□□ 1.48
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USP25-202ENST00000285681 NFE2L2Q16236 605 aa24.28■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.28■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 GRIN2AQ12879 1464 aa24.28■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.28■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 MCM2P49736 904 aa24.27■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.26■■□□□ 1.47
USP25-202ENST00000285681 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.26■■□□□ 1.47
USP25-202ENST00000285681 ZNF428Q96B54 188 aa24.26■■□□□ 1.47
USP25-202ENST00000285681 SDF4Q9BRK5 362 aa24.25■■□□□ 1.47
USP25-202ENST00000285681 PDCP20941 246 aa24.25■■□□□ 1.47
USP25-202ENST00000285681 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.25■■□□□ 1.47
USP25-202ENST00000285681 KDM4AO75164 1064 aa24.25■■□□□ 1.47
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