RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 WWC1Q8IX03 1113 aa24.5■■□□□ 1.51
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USP25-202ENST00000285681 SLC4A2P04920 1241 aa24.49■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 TIAM1Q13009 1591 aa24.49■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
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USP25-202ENST00000285681 NUCB2P80303 420 aa24.47■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.47■■□□□ 1.51
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USP25-202ENST00000285681 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.46■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 PRM3Q9NNZ6 103 aa24.46■■□□□ 1.51
USP25-202ENST00000285681 PSMA5P28066 241 aa24.46■■□□□ 1.51
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USP25-202ENST00000285681 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.44■■□□□ 1.5
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USP25-202ENST00000285681 PDE3AQ14432 1141 aa24.43■■□□□ 1.5
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USP25-202ENST00000285681 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.41■■□□□ 1.5
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USP25-202ENST00000285681 ARHGEF11O15085 1522 aa24.41■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 HIP1O00291 1037 aa24.41■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.41■■□□□ 1.5
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USP25-202ENST00000285681 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.4■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 XBP1P17861 261 aa24.4■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.4■■□□□ 1.5
USP25-202ENST00000285681 IQGAP2Q13576 1575 aa24.4■■□□□ 1.5
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USP25-202ENST00000285681 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
USP25-202ENST00000285681 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.39■■□□□ 1.49
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USP25-202ENST00000285681 MYL6BP14649 208 aa24.35■■□□□ 1.49
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USP25-202ENST00000285681 GRIN2AQ12879 1464 aa24.28■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.28■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 MCM2P49736 904 aa24.27■■□□□ 1.48
USP25-202ENST00000285681 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.26■■□□□ 1.47
USP25-202ENST00000285681 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.26■■□□□ 1.47
USP25-202ENST00000285681 ZNF428Q96B54 188 aa24.26■■□□□ 1.47
USP25-202ENST00000285681 SDF4Q9BRK5 362 aa24.25■■□□□ 1.47
USP25-202ENST00000285681 PDCP20941 246 aa24.25■■□□□ 1.47
USP25-202ENST00000285681 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.25■■□□□ 1.47
USP25-202ENST00000285681 KDM4AO75164 1064 aa24.25■■□□□ 1.47
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