RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 MCM2P49736 904 aa24.64■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 VPS53Q5VIR6 699 aa24.63■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 NCOA1Q15788 1441 aa24.63■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.63■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa24.63■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.63■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 BICD2Q8TD16 824 aa24.63■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 ADGRL1O94910 1474 aa24.62■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.62■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.62■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.62■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 MSH5O43196 834 aa24.61■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 BCAR3O75815 825 aa24.61■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 SLC4A2P04920 1241 aa24.6■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 FSD1Q9BTV5 496 aa24.6■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.6■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 RABEP1Q15276 862 aa24.59■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 WASHC4Q2M389 1173 aa24.58■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.58■■□□□ 1.53
LRIG1-201ENST00000273261 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.57■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa24.57■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.56■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.56■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 SPG7Q9UQ90 795 aa24.56■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 NFE2L2Q16236 605 aa24.55■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.55■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 CEP89Q96ST8 783 aa24.55■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 SLFN5Q08AF3 891 aa24.55■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.55■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.54■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 NFKBIBQ15653 356 aa24.54■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.53■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.53■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 ABCC11Q96J66 1382 aa24.52■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.52■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC184Q52MB2 194 aa24.52■■□□□ 1.52
LRIG1-201ENST00000273261 PDCP20941 246 aa24.51■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.51■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.5■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.49■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 BACH2Q9BYV9 841 aa24.49■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 MBD3O95983 291 aa24.49■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 CABP4P57796 275 aa24.49■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 XBP1P17861 261 aa24.48■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.48■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 NEK4P51957 841 aa24.48■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 ARID3AQ99856 593 aa24.48■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.48■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 MRE11P49959 708 aa24.46■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.45■■□□□ 1.51
LRIG1-201ENST00000273261 NSD2O96028 1365 aa24.45■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa24.45■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.44■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.43■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 RAD21O60216 631 aa24.43■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC27Q2M243 656 aa24.43■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC70Q6NSX1 233 aa24.43■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 FANCAO15360 1455 aa24.42■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 STRN4Q9NRL3 753 aa24.42■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.41■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 FBXW7Q969H0 707 aa24.41■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 IFT57Q9NWB7 429 aa24.41■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.41■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
LRIG1-201ENST00000273261 ANKRD1Q15327 319 aa24.41■■□□□ 1.5
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