RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 SKAP1Q86WV1 359 aa26.2■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.18■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.17■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 PRR36Q9H6K5 1346 aa26.17■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.16■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 NSD2O96028 1365 aa26.16■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.16■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.16■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.15■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
VGF-201ENST00000249330 KCNA6P17658 529 aa26.13■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 FBLN1P23142 703 aa26.11■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 ATP7BP35670 1465 aa26.11■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
VGF-201ENST00000249330 APAF1O14727 1248 aa26.07■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 FAM161AQ3B820 660 aa26.07■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.07■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.07■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 NFKBIBQ15653 356 aa26.06■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 NME9Q86XW9 330 aa26.06■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 DIP2AQ14689 1571 aa26.05■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 GSE1Q14687 1217 aa26.05■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 PTCH1Q13635 1447 aa26.05■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 CFAP53Q96M91 514 aa26.04■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 GOLGA2Q08379 1002 aa26.03■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 ADGRB2O60241 1585 aa26.02■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 SLC4A3P48751 1232 aa26.02■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 ZNF521Q96K83 1311 aa26.01■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.76
VGF-201ENST00000249330 SHPRHQ149N8 1683 aa26.01■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 ACEP12821 1306 aa26.01■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa26.01■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 C8orf34Q49A92 452 aa26.01■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.01■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.99■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 PIK3R4Q99570 1358 aa25.98■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.98■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 PLEKHG3A1L390 1219 aa25.97■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
VGF-201ENST00000249330 NEUROD2Q15784 382 aa25.95■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 POLKQ9UBT6 870 aa25.95■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 SLFN5Q08AF3 891 aa25.95■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 RGS3P49796 1198 aa25.93■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 RUNDC1Q96C34 613 aa25.92■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 COG3Q96JB2 828 aa25.92■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.92■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.92■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 AKAP12Q02952 1782 aa25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 ITSN1Q15811 1721 aa25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.91■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa25.9■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
VGF-201ENST00000249330 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 USP6P35125 1406 aa25.88■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.87■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 WWC1Q8IX03 1113 aa25.85■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 HSPA2P54652 639 aa25.83■■□□□ 1.73
VGF-201ENST00000249330 SOX12O15370 315 aa25.83■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 E9PSI1 815 aa25.81■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 C14orf37Q86TY3 774 aa25.81■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.81■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 SSH2Q76I76 1423 aa25.8■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.8■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.8■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.79■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 BCAR3O75815 825 aa25.79■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.79■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.78■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 NGEFQ8N5V2 710 aa25.78■■□□□ 1.72
VGF-201ENST00000249330 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms