RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.17□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 TSPYL4Q9UJ04 414 aa12.17□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.17□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa12.17□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 PDCL2Q8N4E4 241 aa12.17□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 GCC1Q96CN9 775 aa12.17□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 DCTN1Q14203 1278 aa12.17□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 SCAPERQ9BY12 1400 aa12.17□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.17□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.17□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 SYCE3A1L190 88 aa12.16□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 MTHFSP49914 203 aa12.16□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 TOP2BQ02880 1626 aa12.16□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.16□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 HFM1A2PYH4 1435 aa12.16□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.15□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 PDCL3Q9H2J4 239 aa12.15□□□□□ -0.46
TTL-201ENST00000233336 DDX58O95786 925 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 CHD1LQ86WJ1 897 aa12.14□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 KIAA0754O94854 1291 aa12.14□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 ERBINQ96RT1 1412 aa12.14□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 CBX1P83916 185 aa12.14□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 USP8P40818 1118 aa12.14□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 EID1Q9Y6B2 187 aa12.13□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 KRT85P78386 507 aa12.12□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa12.12□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 IGF1RP08069 1367 aa12.12□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 GPATCH11Q8N954 259 aa12.12□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 FSD1Q9BTV5 496 aa12.12□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 SKAP1Q86WV1 359 aa12.12□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 SMARCE1Q969G3 411 aa12.12□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.12□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 ERICH2A1L162 156 aa12.12□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 FBXO3Q9UK99 471 aa12.11□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 RBM25P49756 843 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 NBPF8Q3BBV2 869 aa12.11□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.11□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 GGNBP2Q9H3C7 697 aa12.11□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 TTC5Q8N0Z6 440 aa12.11□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 GNAI3P08754 354 aa12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 GIMAP7Q8NHV1 300 aa12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 STK38Q15208 465 aa12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 JPH4Q96JJ6 628 aa12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 SERPINC1P01008 464 aa12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 GNAI2P04899 355 aa12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 CABP2Q9NPB3 220 aa12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 FILIP1LQ4L180 1135 aa12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 TRERF1Q96PN7 1200 aa12.1□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 EPS15P42566 896 aa12.09□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.09□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 SURF6O75683 361 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 DYDC1Q8WWB3 177 aa12.09□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 HIP1O00291 1037 aa12.09□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 WDR63Q8IWG1 891 aa12.09□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 C20orf194Q5TEA3 1177 aa12.09□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 ME1P48163 572 aa12.09□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
TTL-201ENST00000233336 ERLIN1O75477 346 aa12.08□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 NUP62CLQ9H1M0 184 aa12.08□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa12.08□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 CENPHQ9H3R5 247 aa12.08□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 NEUROD6Q96NK8 337 aa12.08□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 BRMS1Q9HCU9 246 aa12.08□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 WASHC4Q2M389 1173 aa12.08□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 NBPF1Q3BBV0 1214 aa12.08□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 KDM4AO75164 1064 aa12.08□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 ANKRD1Q15327 319 aa12.08□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 MYO6Q9UM54 1294 aa12.07□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 TBC1D2Q9BYX2 928 aa12.07□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 PRKAR2BP31323 418 aa12.07□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 AMOTL1Q8IY63 956 aa12.07□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 LRRCC1Q9C099 1032 aa12.07□□□□□ -0.48
TTL-201ENST00000233336 STK11IPQ8N1F8 1099 aa12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.2 ms