RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.19■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.18■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 RGS3P49796 1198 aa20.18■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.17■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 ADGRB2O60241 1585 aa20.17■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 C8orf34Q49A92 452 aa20.16■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 NLRP1Q9C000 1473 aa20.16■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa20.16■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.16■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 TSPOAP1O95153 1857 aa20.16■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 DLC1Q96QB1 1528 aa20.16■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 MLECQ14165 292 aa20.15■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 WAPLQ7Z5K2 1190 aa20.15■□□□□ 0.82
POP4-201ENST00000221770 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.14■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 PNPLA6Q8IY17 1366 aa20.13■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa20.13■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.13■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.13■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 IL16Q14005 1332 aa20.12■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 RLBP1P12271 317 aa20.11■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 RIPK4P57078 832 aa20.09■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.09■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 TNNQ9UQP3 1299 aa20.09■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 ATP7BP35670 1465 aa20.09■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 FCHSD2O94868 740 aa20.08■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 ZMYND15Q9H091 742 aa20.08■□□□□ 0.81
POP4-201ENST00000221770 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa20.07■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 ZMYM3Q14202 1370 aa20.07■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 WASLO00401 505 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 POLKQ9UBT6 870 aa20.06■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 SIRT1Q96EB6 747 aa20.05■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.05■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 NEFMP07197 916 aa20.04■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 KIF20BQ96Q89 1820 aa20.04■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 METP08581 1390 aa20.03■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.02■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
POP4-201ENST00000221770 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.02■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.02■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.02■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 USP35Q9P2H5 1018 aa20.01■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.01■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 FBLN1P23142 703 aa20.01■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 PRKAR2BP31323 418 aa20■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa20■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.99■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa19.99■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.99■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 CCDC61Q9Y6R9 512 aa19.99■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa19.99■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 TRIM27P14373 513 aa19.98■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 DDX19BQ9UMR2 479 aa19.97■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 TNRQ92752 1358 aa19.97■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 NME9Q86XW9 330 aa19.97■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 NFE2L2Q16236 605 aa19.96■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 ALDH1L2Q3SY69 923 aa19.96■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 AATKQ6ZMQ8 1374 aa19.96■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 SLC4A3P48751 1232 aa19.96■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.96■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 COG3Q96JB2 828 aa19.96■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa19.96■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 TECPR2O15040 1411 aa19.96■□□□□ 0.79
POP4-201ENST00000221770 IL13P35225 146 aa19.95■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 KIF16BQ96L93 1317 aa19.95■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.94■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 HMOX1P09601 288 aa19.94■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.94■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 ZNF428Q96B54 188 aa19.94■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 PHACTR3Q96KR7 559 aa19.93■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 BRPF3Q9ULD4 1205 aa19.93■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 ZRANB1Q9UGI0 708 aa19.93■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 TMEM2Q9UHN6 1383 aa19.93■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 USP19O94966 1318 aa19.92■□□□□ 0.78
POP4-201ENST00000221770 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms