RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 A0A1W2PP64 1363 aa23.92■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.91■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.91■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.9■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 PLIN1O60240 522 aa23.9■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 DUSP27Q5VZP5 1158 aa23.9■■□□□ 1.42
USP18-201ENST00000215794 FMN2Q9NZ56 1722 aa23.88■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 GOLGA2Q08379 1002 aa23.88■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.88■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.87■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.87■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.87■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 MTHFSP49914 203 aa23.86■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.85■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.84■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.84■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 NSD2O96028 1365 aa23.84■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 SLFN5Q08AF3 891 aa23.83■■□□□ 1.41
USP18-201ENST00000215794 ORAI2Q96SN7 254 aa23.81■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.81■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 ATF3P18847 181 aa23.8■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.8■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 ACEP12821 1306 aa23.79■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 MSH6P52701 1360 aa23.79■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.79■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.77■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 C20orf194Q5TEA3 1177 aa23.77■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 ITSN1Q15811 1721 aa23.77■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 ANKARQ7Z5J8 1434 aa23.77■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 CRBNQ96SW2 442 aa23.77■■□□□ 1.4
USP18-201ENST00000215794 CFAP53Q96M91 514 aa23.76■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 FYB1O15117 783 aa23.75■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.75■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 MST1RQ04912 1400 aa23.74■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.74■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 NEUROD2Q15784 382 aa23.74■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 RUNDC1Q96C34 613 aa23.74■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.74■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.74■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.74■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 AKAP12Q02952 1782 aa23.73■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 WWC1Q8IX03 1113 aa23.73■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.73■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 E9PSI1 815 aa23.72■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.72■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.71■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.71■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.71■■□□□ 1.39
USP18-201ENST00000215794 DCCP43146 1447 aa23.7■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 FOXO3O43524 673 aa23.7■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 NGEFQ8N5V2 710 aa23.7■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.7■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 NME9Q86XW9 330 aa23.69■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.69■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 USP6P35125 1406 aa23.68■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.65■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 BCAR3O75815 825 aa23.65■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 SLAIN2Q9P270 581 aa23.65■■□□□ 1.38
USP18-201ENST00000215794 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.64■■□□□ 1.37
USP18-201ENST00000215794 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
USP18-201ENST00000215794 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.64■■□□□ 1.37
USP18-201ENST00000215794 PLEKHG5O94827 1062 aa23.63■■□□□ 1.37
USP18-201ENST00000215794 FBLN1P23142 703 aa23.63■■□□□ 1.37
USP18-201ENST00000215794 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
USP18-201ENST00000215794 PSME1Q06323 249 aa23.62■■□□□ 1.37
USP18-201ENST00000215794 BRINP3Q76B58 766 aa23.62■■□□□ 1.37
USP18-201ENST00000215794 SSH2Q76I76 1423 aa23.6■■□□□ 1.37
USP18-201ENST00000215794 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
USP18-201ENST00000215794 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.59■■□□□ 1.37
USP18-201ENST00000215794 SOX12O15370 315 aa23.58■■□□□ 1.37
USP18-201ENST00000215794 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.57■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 KIF1AQ12756 1690 aa23.57■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 CCDC27Q2M243 656 aa23.57■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 PIK3C2AO00443 1686 aa23.56■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 MSH5O43196 834 aa23.56■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.56■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 WDR63Q8IWG1 891 aa23.56■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 PNPLA6Q8IY17 1366 aa23.56■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.56■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 SKAP1Q86WV1 359 aa23.54■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 ABTB2Q8N961 1025 aa23.54■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
USP18-201ENST00000215794 POLKQ9UBT6 870 aa23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms