RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dnajc5P60904 198 aa28.88■■■□□ 2.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 4933402E13RikQ9D4D2 429 aa28.88■■■□□ 2.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 PalldQ9ET54 1408 aa28.88■■■□□ 2.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Skint5A7XUY5 1461 aa28.88■■■□□ 2.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa28.86■■■□□ 2.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Hs1bp3Q3TC93 395 aa28.84■■■□□ 2.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pdcl3Q8BVF2 240 aa28.84■■■□□ 2.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Antxr1Q9CZ52 562 aa28.84■■■□□ 2.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa28.84■■■□□ 2.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 AU022751B1B0V2 589 aa28.82■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa28.82■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa28.82■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Znf330Q922H9 316 aa28.82■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa28.81■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lrrc7Q80TE7 1490 aa28.81■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Synj2Q9D2G5 1434 aa28.8■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 AU019823E9PUQ3 292 aa28.79■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc60Q8C4J0 545 aa28.79■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Slc52a2Q9D8F3 450 aa28.79■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 CastP51125 788 aa28.79■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 MaddQ80U28 1577 aa28.79■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Catsper2A2ARP9 588 aa28.79■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa28.78■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ciz1Q8VEH2 845 aa28.78■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kif18aQ91WD7 886 aa28.78■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Trpm1Q2TV84 1622 aa28.77■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Stk26Q99JT2 416 aa28.77■■■□□ 2.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cavin4A2AMM0 362 aa28.75■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Terf2O35144 541 aa28.75■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Adgrl1Q80TR1 1466 aa28.75■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 SkilQ60665 675 aa28.74■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Phf14Q9D4H9 881 aa28.74■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Afap1Q80YS6 731 aa28.73■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Atp1b4Q99ME6 356 aa28.73■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mcm4P49717 862 aa28.72■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ssh1Q76I79 1042 aa28.72■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cog6Q8R3I3 657 aa28.71■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa28.7■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Plcb2A3KGF7 1181 aa28.7■■■□□ 2.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kif2cQ922S8 721 aa28.69■■■□□ 2.18
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zranb1Q7M760 708 aa28.68■■■□□ 2.18
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa28.68■■■□□ 2.18
Nisch-222ENSMUST00000172142 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ankrd50F7BE84 1390 aa28.68■■■□□ 2.18
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gtf2a1Q99PM3 378 aa28.67■■■□□ 2.18
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nutm1Q8BHP2 1126 aa28.66■■■□□ 2.18
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tecpr2Q3UH45 1423 aa28.65■■■□□ 2.18
Nisch-222ENSMUST00000172142 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ino80Q6ZPV2 1559 aa28.65■■■□□ 2.18
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kif20aP97329 887 aa28.65■■■□□ 2.18
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tmco5bQ80X59 307 aa28.64■■■□□ 2.18
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nrxn1Q9CS84 1514 aa28.63■■■□□ 2.17
Nisch-222ENSMUST00000172142 Brd1E9PZ26 1189 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
Nisch-222ENSMUST00000172142 FanciQ8K368 1330 aa28.62■■■□□ 2.17
Nisch-222ENSMUST00000172142 PaskQ8CEE6 1383 aa28.62■■■□□ 2.17
Nisch-222ENSMUST00000172142 Swt1Q9DBQ9 907 aa28.62■■■□□ 2.17
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rfx1P48377 963 aa28.61■■■□□ 2.17
Nisch-222ENSMUST00000172142 NpatQ8BMA5 1420 aa28.6■■■□□ 2.17
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nectin2P32507 530 aa28.6■■■□□ 2.17
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rsph3aQ3UFY4 516 aa28.59■■■□□ 2.17
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gsto1O09131 240 aa28.57■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm10093D3YYI8 482 aa28.57■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Znf692Q3U381 531 aa28.57■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ift172Q6VH22 1749 aa28.57■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Akap12Q9WTQ5 1684 aa28.57■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Shq1Q7TMX5 569 aa28.56■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wwc1Q5SXA9 1104 aa28.55■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Uhrf1bp1B2KF50 1429 aa28.54■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cetn4Q8K4K1 168 aa28.54■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Slc12a5Q91V14 1138 aa28.54■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fchsd2Q3USJ8 740 aa28.54■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ecm2Q5FW85 670 aa28.54■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Il4rP16382 810 aa28.53■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa28.53■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pik3r4Q8VD65 1358 aa28.53■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Aplp1Q03157 653 aa28.53■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa28.53■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 PalmQ9Z0P4 383 aa28.53■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Q3UPC7 1272 aa28.51■■■□□ 2.15
Nisch-222ENSMUST00000172142 MvpQ9EQK5 861 aa28.51■■■□□ 2.15
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mroh1E0CZ22 1640 aa28.5■■■□□ 2.15
Nisch-222ENSMUST00000172142 NinlQ6ZQ12 1394 aa28.5■■■□□ 2.15
Nisch-222ENSMUST00000172142 GorabQ8BRM2 368 aa28.5■■■□□ 2.15
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rrp9Q91WM3 475 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
Nisch-222ENSMUST00000172142 Knl1Q66JQ7 1612 aa28.49■■■□□ 2.15
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wdr63B2RY71 923 aa28.48■■■□□ 2.15
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Nisch-222ENSMUST00000172142 Isy1Q69ZQ2 285 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.3 ms