RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165559.1

Ctif-201, Transcript of CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ctif, Length 6,173 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctif-201ENSMUST00000165559 BC005561E9Q5E2 1589 aa14.65□□□□□ -0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tceal9Q9DD24 104 aa14.65□□□□□ -0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Usp16Q99LG0 825 aa14.65□□□□□ -0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Podxl2Q8CAE9 603 aa14.65□□□□□ -0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 TnnQ80Z71 1560 aa14.65□□□□□ -0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Talpid3E9PV87 1520 aa14.65□□□□□ -0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Naip1Q9QWK5 1403 aa14.65□□□□□ -0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ptch1Q61115 1434 aa14.64□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Naip6Q9JIB6 1403 aa14.64□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ralbp1Q62172 648 aa14.64□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Esx1O88933 382 aa14.63□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Triml2E9PW10 424 aa14.63□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cnnm1Q0GA42 951 aa14.62□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Smarcc1P97496 1104 aa14.62□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 NexnQ7TPW1 607 aa14.62□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Yeats2Q3TUF7 1407 aa14.62□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 AampJ3QN89 436 aa14.61□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pde4dQ01063 747 aa14.61□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Armc3A2AU72 881 aa14.61□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kif24Q6NWW5 1356 aa14.61□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gnai1B2RSH2 354 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ric3Q8BPM6 367 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gnai3Q9DC51 354 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 BcanQ61361 883 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zfp644E9QA22 1323 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm21969J3QJZ1 289 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Foxd1Q61345 456 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Psrc1Q9D0P7 329 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Vps8Q0P5W1 1427 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Neurod6P48986 337 aa14.6□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 PzpQ61838 1495 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Calcoco2A2A6M5 331 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Flad1Q8R123 492 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kdm6bQ5NCY0 1641 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Bcl2l13P59017 434 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 IncenpQ9WU62 880 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Swt1Q9DBQ9 907 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rnf17Q99MV7 1640 aa14.59□□□□□ -0.07
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ppp1r1bQ60829 194 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Q8C5K5 320 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Slc5a1Q8C3K6 665 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trappc8E9PWG2 1437 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Kcna6Q61923 529 aa14.58□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cfap65Q3V0B4 1847 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 St5Q924W7 1134 aa14.57□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Filip1lQ6P6L0 1131 aa14.56□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Klhdc4Q921I2 584 aa14.56□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Eno4Q8C042 619 aa14.56□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Abcc2Q8VI47 1543 aa14.56□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 RdxP26043 583 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 St18Q80TY4 1045 aa14.56□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rbm25B2RY56 838 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ncoa3O09000 1398 aa14.56□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sytl4Q9R0Q1 673 aa14.56□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Znf608Q56A10 1511 aa14.56□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Krt82Q99M74 516 aa14.55□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hfm1D3Z4R1 1434 aa14.55□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Map3k4O08648 1597 aa14.55□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ak9G3UYQ4 1894 aa14.55□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 CrcpO35427 148 aa14.54□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cplx2P84086 134 aa14.54□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nap1l3Q794H2 544 aa14.54□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trim58Q5NCC9 485 aa14.54□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sv2bQ8BG39 683 aa14.54□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rsph3aQ3UFY4 516 aa14.54□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 AU015836B2RUM3 263 aa14.54□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ankrd26Q811D2 1581 aa14.54□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa14.53□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa14.53□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nectin2P32507 530 aa14.53□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ccp110Q7TSH4 1004 aa14.53□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Evc2Q8K1G2 1220 aa14.53□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Sf3a1Q8K4Z5 791 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Phf23Q8BSN5 401 aa14.52□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Strn4P58404 760 aa14.52□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa14.52□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 BccipQ9CWI3 316 aa14.52□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Ctif-201ENSMUST00000165559 MsnP26041 577 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 ChgaP26339 463 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ccdc30Q8BVF4 654 aa14.52□□□□□ -0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tpm4Q6IRU2 248 aa14.52□□□□□ -0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 KinQ8K339 391 aa14.52□□□□□ -0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ripk4Q9ERK0 786 aa14.52□□□□□ -0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ell2Q3UKU1 639 aa14.51□□□□□ -0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rnf20Q5DTM8 973 aa14.51□□□□□ -0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pcf11G3X9Z4 1553 aa14.51□□□□□ -0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hmox1P14901 289 aa14.51□□□□□ -0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tpm2P58774 284 aa14.51□□□□□ -0.09
Ctif-201ENSMUST00000165559 Idi2Q8BFZ6 227 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 66.5 ms