RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049575.7

Cltb-201, Transcript of Clathrin light chain B, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cltb, Length 1,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cltb-201ENSMUST00000049575 Rgs17Q9QZB0 210 aa23.74■■□□□ 1.39
Cltb-201ENSMUST00000049575 Tet3Q8BG87 1668 aa23.73■■□□□ 1.39
Cltb-201ENSMUST00000049575 Sbno1Q689Z5 1390 aa23.73■■□□□ 1.39
Cltb-201ENSMUST00000049575 PaskQ8CEE6 1383 aa23.73■■□□□ 1.39
Cltb-201ENSMUST00000049575 Map3k19E9Q3S4 1311 aa23.72■■□□□ 1.39
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa23.72■■□□□ 1.39
Cltb-201ENSMUST00000049575 Card11Q8CIS0 1159 aa23.71■■□□□ 1.39
Cltb-201ENSMUST00000049575 Nfat5Q9WV30 1534 aa23.7■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 Rock2P70336 1388 aa23.7■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 Idi2Q8BFZ6 227 aa23.7■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa23.69■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 InhbeO08717 350 aa23.68■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 Dzip1Q8BMD2 852 aa23.68■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 Exosc9Q9JHI7 438 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 TimelessQ9R1X4 1197 aa23.68■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 Bcl9lQ67FY2 1494 aa23.67■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa23.66■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ltbp1Q8CG19 1712 aa23.65■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 CatipB9EKE5 520 aa23.65■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cnga1P29974 684 aa23.65■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 Shank2Q80Z38 1476 aa23.64■■□□□ 1.38
Cltb-201ENSMUST00000049575 FanciQ8K368 1330 aa23.63■■□□□ 1.37
Cltb-201ENSMUST00000049575 InsrP15208 1372 aa23.63■■□□□ 1.37
Cltb-201ENSMUST00000049575 Zmym3Q9JLM4 1370 aa23.62■■□□□ 1.37
Cltb-201ENSMUST00000049575 Nid2O88322 1403 aa23.61■■□□□ 1.37
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ildr2B5TVM2 661 aa23.59■■□□□ 1.37
Cltb-201ENSMUST00000049575 Col22a1E9Q7P1 1613 aa23.59■■□□□ 1.37
Cltb-201ENSMUST00000049575 Rtl5Q5DTT4 599 aa23.58■■□□□ 1.37
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cacna1sQ02789 1880 aa23.57■■□□□ 1.36
Cltb-201ENSMUST00000049575 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
Cltb-201ENSMUST00000049575 ZgpatQ8VDM1 511 aa23.55■■□□□ 1.36
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ccdc129Q14B48 1034 aa23.53■■□□□ 1.36
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kif16bB1AVY7 1312 aa23.53■■□□□ 1.36
Cltb-201ENSMUST00000049575 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa23.53■■□□□ 1.36
Cltb-201ENSMUST00000049575 Gm21698A0A087WQP8 267 aa23.52■■□□□ 1.36
Cltb-201ENSMUST00000049575 Gm21671G3UY31 267 aa23.52■■□□□ 1.36
Cltb-201ENSMUST00000049575 Fer1l6E0CZ42 1862 aa23.51■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 TonslQ6NZL6 1363 aa23.5■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 Gimap6Q8K349 305 aa23.49■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 Mast2Q60592 1734 aa23.49■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 Znf335A2A5K6 1337 aa23.49■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 Pard3Q99NH2 1333 aa23.49■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 Tnks1bp1P58871 1720 aa23.48■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 HdgfP51859 237 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa23.48■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa23.48■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ncoa4Q5U4H9 625 aa23.47■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa23.46■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 Sugp2Q8CH09 1067 aa23.46■■□□□ 1.35
Cltb-201ENSMUST00000049575 Robo1O89026 1612 aa23.44■■□□□ 1.34
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ubap1lG3UW59 384 aa23.43■■□□□ 1.34
Cltb-201ENSMUST00000049575 Dennd6aQ8BH65 605 aa23.43■■□□□ 1.34
Cltb-201ENSMUST00000049575 Nlgn1Q99K10 843 aa23.43■■□□□ 1.34
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ly75Q60767 1723 aa23.42■■□□□ 1.34
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ubr1O70481 1757 aa23.41■■□□□ 1.34
Cltb-201ENSMUST00000049575 Nup153E9Q3G8 1462 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ccdc6D3YZP9 469 aa23.4■■□□□ 1.34
Cltb-201ENSMUST00000049575 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa23.4■■□□□ 1.34
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kat6bQ8BRB7 1872 aa23.39■■□□□ 1.34
Cltb-201ENSMUST00000049575 Dnajc10Q9DC23 793 aa23.39■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Akap11E9Q777 1895 aa23.38■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 TnrQ8BYI9 1358 aa23.38■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Mdc1Q5PSV9 1707 aa23.37■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Card10P58660 1021 aa23.37■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa23.37■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Slx1bQ8BX32 270 aa23.37■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Map2P20357 1828 aa23.36■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Scn7aB1AYL1 1681 aa23.35■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa23.35■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Amotl2Q8K371 772 aa23.34■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cabp4Q8VHC5 271 aa23.34■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Astn2Q80Z10 1352 aa23.34■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kcnh5Q920E3 988 aa23.32■■□□□ 1.32
Cltb-201ENSMUST00000049575 FancaQ9JL70 1439 aa23.32■■□□□ 1.32
Cltb-201ENSMUST00000049575 Slc24a1Q91WD8 1130 aa23.31■■□□□ 1.32
Cltb-201ENSMUST00000049575 Slc4a1apE9PX68 744 aa23.3■■□□□ 1.32
Cltb-201ENSMUST00000049575 RgmbQ7TQ33 436 aa23.3■■□□□ 1.32
Cltb-201ENSMUST00000049575 Pm20d1Q8C165 503 aa23.3■■□□□ 1.32
Cltb-201ENSMUST00000049575 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
Cltb-201ENSMUST00000049575 TatQ8QZR1 454 aa23.29■■□□□ 1.32
Cltb-201ENSMUST00000049575 Taok3Q8BYC6 898 aa23.28■■□□□ 1.32
Cltb-201ENSMUST00000049575 Fmnl2A2APV2 1086 aa23.27■■□□□ 1.32
Cltb-201ENSMUST00000049575 Zeb2Q9R0G7 1215 aa23.27■■□□□ 1.32
Cltb-201ENSMUST00000049575 Nwd2Q6P5U7 1742 aa23.27■■□□□ 1.32
Cltb-201ENSMUST00000049575 Tmem132eQ6IEE6 982 aa23.26■■□□□ 1.31
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa23.25■■□□□ 1.31
Cltb-201ENSMUST00000049575 CemipQ8BI06 1361 aa23.24■■□□□ 1.31
Cltb-201ENSMUST00000049575 FocadA2AKG8 1798 aa23.22■■□□□ 1.31
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ano8Q6PB70 1060 aa23.21■■□□□ 1.31
Cltb-201ENSMUST00000049575 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
Cltb-201ENSMUST00000049575 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa23.19■■□□□ 1.3
Cltb-201ENSMUST00000049575 GakQ99KY4 1305 aa23.18■■□□□ 1.3
Cltb-201ENSMUST00000049575 CrklP47941 303 aa23.18■■□□□ 1.3
Cltb-201ENSMUST00000049575 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa23.17■■□□□ 1.3
Cltb-201ENSMUST00000049575 Pak3Q61036 559 aa23.17■■□□□ 1.3
Cltb-201ENSMUST00000049575 OptnQ8K3K8 584 aa23.17■■□□□ 1.3
Cltb-201ENSMUST00000049575 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9 ms