RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025421.7

Seh1l-201, Transcript of Nucleoporin SEH1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Seh1l, Length 3,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa20.65■□□□□ 0.9
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Dip2cE9PWR4 1557 aa20.65■□□□□ 0.9
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ppm1gQ61074 542 aa20.64■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Aifm3Q3TY86 605 aa20.63■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 InsrP15208 1372 aa20.63■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa20.62■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Atf7ipQ7TT18 1306 aa20.62■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Pola1P33609 1465 aa20.62■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Hecw1Q8K4P8 1604 aa20.62■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Prim1P20664 417 aa20.62■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Q3UJC8 639 aa20.62■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Myo5cE9Q1F5 1742 aa20.61■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Hfm1D3Z4R1 1434 aa20.61■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 CastP51125 788 aa20.61■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Irx3P81067 507 aa20.61■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Iqgap3F8VQ29 1632 aa20.61■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rfx1P48377 963 aa20.61■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cog6Q8R3I3 657 aa20.61■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 FanciQ8K368 1330 aa20.6■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Q3TQI7 289 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ccne1Q61457 408 aa20.6■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ric3Q8BPM6 367 aa20.6■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Plcd4Q8K3R3 807 aa20.6■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ap3b2Q9JME5 1082 aa20.6■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gm10563F6WIE4 79 aa20.59■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 TnikP83510 1323 aa20.59■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Q3UPC7 1272 aa20.59■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa20.59■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Pip4k2bQ80XI4 416 aa20.59■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 CalcaP70160 136 aa20.58■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 DekQ7TNV0 380 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Smarca5Q91ZW3 1051 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa20.57■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rims1Q99NE5 1463 aa20.57■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Uggt2E9Q4X2 1504 aa20.56■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Tmem94Q7TSH8 1360 aa20.56■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa20.56■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Efcab6Q6P1E8 1516 aa20.56■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa20.56■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Talpid3E9PV87 1520 aa20.55■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Idi1P58044 227 aa20.54■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Eif4a2P10630 407 aa20.53■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa20.53■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Evi5lH3BKQ3 813 aa20.52■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa20.52■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Slc35g1Q8BY79 368 aa20.52■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Dennd6aQ8BH65 605 aa20.51■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Knl1Q66JQ7 1612 aa20.51■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Nkx1-2P42580 305 aa20.5■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 NpatQ8BMA5 1420 aa20.5■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Fndc1E9Q043 1732 aa20.49■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Plcb2A3KGF7 1181 aa20.49■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Rsph6aQ8CDR2 708 aa20.49■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa20.49■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Kif18aQ91WD7 886 aa20.48■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Setd1aE9PYH6 1716 aa20.48■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Naip7Q9JIB3 1402 aa20.47■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gnai1B2RSH2 354 aa20.47■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 GnpatP98192 678 aa20.47■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Idi2Q8BFZ6 227 aa20.47■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gnai3Q9DC51 354 aa20.47■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Nek4Q9Z1J2 792 aa20.47■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa20.47■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Atp10aO54827 1508 aa20.46■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Map3k13Q1HKZ5 959 aa20.46■□□□□ 0.87
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Neurl4Q5NCX5 1563 aa20.45■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 RereQ80TZ9 1558 aa20.45■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Vamp4O70480 141 aa20.45■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Abca17E9PX95 1733 aa20.44■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Amotl2Q8K371 772 aa20.44■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ankrd50F7BE84 1390 aa20.44■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Fam83gQ5SWY7 812 aa20.44■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ppp1r15aP17564 657 aa20.43■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Fkbp4P30416 458 aa20.43■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa20.42■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 CatipB9EKE5 520 aa20.42■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Jarid2Q62315 1234 aa20.42■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Fyb1O35601 819 aa20.41■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Mre11Q61216 706 aa20.39■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa20.39■□□□□ 0.86
Seh1l-201ENSMUST00000025421 PtprmP28828 1452 aa20.39■□□□□ 0.85
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa20.39■□□□□ 0.85
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa20.39■□□□□ 0.85
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Myom2Q14BI5 1463 aa20.38■□□□□ 0.85
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa20.38■□□□□ 0.85
Seh1l-201ENSMUST00000025421 SkilQ60665 675 aa20.38■□□□□ 0.85
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Nsd3Q6P2L6 1439 aa20.38■□□□□ 0.85
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Eya1P97767 591 aa20.38■□□□□ 0.85
Seh1l-201ENSMUST00000025421 Sv2bQ8BG39 683 aa20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.5 ms