RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559974.5

RABGGTA-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,963 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-212ENST00000559974 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PATJQ8NI35 1801 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 OPHN1O60890 802 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 KRT37O76014 449 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PCSK1P29120 753 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 NEK3P51956 506 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 RABGGTBP53611 331 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CACNA2D1P54289 1103 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 AP1B1Q10567 949 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 BNIP1Q12981 228 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 GPNMBQ14956 572 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 RFX8Q6ZV50 586 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 MPP5Q8N3R9 675 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF276Q8N554 614 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 RNF169Q8NCN4 708 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 P2RY11Q96G91 374 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 KLC4Q9NSK0 619 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 NUP205Q92621 2012 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 LAMA3Q16787 3333 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 RNF103O00237 685 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 DCLK1O15075 740 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM155BO75949 473 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PYGBP11216 843 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 MLNP12872 115 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 ADRA1BP35368 520 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 GRIA1P42261 906 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 RAB27AP51159 221 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SCAPQ12770 1279 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 TIGD5Q53EQ6 642 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 LGSNQ5TDP6 509 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 TNS4Q8IZW8 715 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SCLYQ96I15 445 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTA-212ENST00000559974 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 TRIM43BA6NCK2 446 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 CFAP73A6NFT4 308 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM159BA6NKW6 160 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 HHLA1C9JL84 531 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF623O75123 536 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 LTFP02788 710 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 USP17L7P0C7H9 530 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 ODC1P11926 461 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 NCAM1P13591 858 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 CD52P31358 61 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 CYP2C18P33260 490 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 NCALDP61601 193 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 TCTN1Q2MV58 587 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 ADAM32Q8TC27 787 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 APBB2Q92870 758 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 ECT2Q9H8V3 914 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 RRN3Q9NYV6 651 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 PADI3Q9ULW8 664 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 WDR91A4D1P6 747 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 ETV4P43268 484 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 CCL23P55773 120 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 SEMA3BQ13214 749 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 CHSY1Q86X52 802 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 NETO2Q8NC67 525 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 CCNYQ8ND76 341 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 MYLPFQ96A32 169 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 MGEA5O60502 916 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 CSH1P0DML2 217 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 CSH2P0DML3 217 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 WASHC5Q12768 1159 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 FYB2Q5VWT5 728 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTA-212ENST00000559974 LRRC8BQ6P9F7 803 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.3 ms