RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MBD6Q96DN6 1003 aa5.4□□□□□ -1.54
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SIL1Q9H173 461 aa5.4□□□□□ -1.54
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa5.4□□□□□ -1.54
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D3EA0A087X179 549 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D3HP0C7X1 549 aa5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 CSH2P0DML3 217 aa5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 KCNA2P16389 499 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 RARSP54136 660 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 PTP4A2Q12974 167 aa5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 DENND1BQ6P3S1 775 aa5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZSWIM1Q9BR11 485 aa5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 SUFUQ9UMX1 484 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 AGAP14A8MT82 685 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H7C0S8 307 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 M0QZQ0 153 aa5.38□□□□□ -1.55
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 VNN1O95497 513 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM225BP0DP42 221 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ITGB7P26010 798 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RCAN1P53805 252 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SP2Q02086 613 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MTAPQ13126 283 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CLCA4Q14CN2 919 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
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