Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y616

IRAK3, Interleukin-1 receptor-associated kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK3Q9Y616 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
IRAK3Q9Y616 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
IRAK3Q9Y616 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
IRAK3Q9Y616 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
IRAK3Q9Y616 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
IRAK3Q9Y616 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
IRAK3Q9Y616 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
IRAK3Q9Y616 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
IRAK3Q9Y616 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
IRAK3Q9Y616 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
IRAK3Q9Y616 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
IRAK3Q9Y616 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
IRAK3Q9Y616 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IRAK3Q9Y616 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
IRAK3Q9Y616 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
IRAK3Q9Y616 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
IRAK3Q9Y616 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
IRAK3Q9Y616 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
IRAK3Q9Y616 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
IRAK3Q9Y616 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
IRAK3Q9Y616 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
IRAK3Q9Y616 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
IRAK3Q9Y616 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IRAK3Q9Y616 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IRAK3Q9Y616 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
IRAK3Q9Y616 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
IRAK3Q9Y616 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
IRAK3Q9Y616 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
IRAK3Q9Y616 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
IRAK3Q9Y616 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
IRAK3Q9Y616 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
IRAK3Q9Y616 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
IRAK3Q9Y616 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
IRAK3Q9Y616 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
IRAK3Q9Y616 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
IRAK3Q9Y616 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
IRAK3Q9Y616 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
IRAK3Q9Y616 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
IRAK3Q9Y616 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
IRAK3Q9Y616 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
IRAK3Q9Y616 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
IRAK3Q9Y616 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
IRAK3Q9Y616 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
IRAK3Q9Y616 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
IRAK3Q9Y616 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
IRAK3Q9Y616 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
IRAK3Q9Y616 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
IRAK3Q9Y616 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
IRAK3Q9Y616 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
IRAK3Q9Y616 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
IRAK3Q9Y616 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
IRAK3Q9Y616 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IRAK3Q9Y616 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
IRAK3Q9Y616 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IRAK3Q9Y616 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IRAK3Q9Y616 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IRAK3Q9Y616 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
IRAK3Q9Y616 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
IRAK3Q9Y616 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
IRAK3Q9Y616 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
IRAK3Q9Y616 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
IRAK3Q9Y616 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
IRAK3Q9Y616 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
IRAK3Q9Y616 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
IRAK3Q9Y616 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
IRAK3Q9Y616 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
IRAK3Q9Y616 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
IRAK3Q9Y616 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
IRAK3Q9Y616 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
IRAK3Q9Y616 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
IRAK3Q9Y616 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
IRAK3Q9Y616 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
IRAK3Q9Y616 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
IRAK3Q9Y616 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
IRAK3Q9Y616 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
IRAK3Q9Y616 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
IRAK3Q9Y616 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
IRAK3Q9Y616 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
IRAK3Q9Y616 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
IRAK3Q9Y616 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
IRAK3Q9Y616 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
IRAK3Q9Y616 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
IRAK3Q9Y616 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
IRAK3Q9Y616 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
IRAK3Q9Y616 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
IRAK3Q9Y616 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
IRAK3Q9Y616 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
IRAK3Q9Y616 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
IRAK3Q9Y616 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
IRAK3Q9Y616 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
IRAK3Q9Y616 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
IRAK3Q9Y616 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
IRAK3Q9Y616 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
IRAK3Q9Y616 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
IRAK3Q9Y616 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
IRAK3Q9Y616 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
IRAK3Q9Y616 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
IRAK3Q9Y616 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
IRAK3Q9Y616 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
IRAK3Q9Y616 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms