RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.06■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 PATJQ8NI35 1801 aa20.06■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 A0A1W2PQH9 124 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 TULP2O00295 520 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 TLR5O60602 858 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 IFNAR2P48551 515 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 PSEN1P49768 467 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 MFAP3P55082 362 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 STILQ15468 1287 aa20.05■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 SLC35F5Q8WV83 523 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 KCTD13Q8WZ19 329 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 ATP2A3Q93084 1043 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.05■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 KCNJ18B7U540 433 aa20.04■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 KCNJ12Q14500 433 aa20.04■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 TMEM63CQ9P1W3 806 aa20.04■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 CFAP97Q9P2B7 532 aa20.04■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 RARGP13631 454 aa20.03■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.03■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 IER2Q9BTL4 223 aa20.03■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 BRD2P25440 801 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 APBA1Q02410 837 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 NR1H3Q13133 447 aa20.02■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 PON2Q15165 354 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 TMEM196Q5HYL7 178 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 DGKKQ5KSL6 1271 aa20.02■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
NISCH-209ENST00000485765 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.02■□□□□ 0.8
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NISCH-209ENST00000485765 PMF1Q6P1K2 205 aa20.01■□□□□ 0.79
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NISCH-209ENST00000485765 RALAP11233 206 aa20■□□□□ 0.79
NISCH-209ENST00000485765 KRT5P13647 590 aa20■□□□□ 0.79
NISCH-209ENST00000485765 GPD2P43304 727 aa20■□□□□ 0.79
NISCH-209ENST00000485765 LRRC32Q14392 662 aa20■□□□□ 0.79
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