RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W DMA2P53924 522 aa6.03□□□□□ -1.44
SNX4YJL036W GIS4Q04233 774 aa6.03□□□□□ -1.44
SNX4YJL036W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SNX4YJL036W INP52P50942 1183 aa6.02□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W AI3P03877 415 aa6.01□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W OMA1P36163 345 aa6□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W UBP1P25037 809 aa5.99□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W KAP122P32767 1081 aa5.99□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W PGM1P33401 570 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W SCD5P34758 872 aa5.99□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W ACS2P52910 683 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W GAS5Q08193 484 aa5.99□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W HXT5P38695 592 aa5.98□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W YNR040WP53736 256 aa5.98□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W PHO87P25360 923 aa5.97□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W APM2P38700 605 aa5.97□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W RRM3P38766 723 aa5.97□□□□□ -1.45
SNX4YJL036W SAC7P17121 654 aa5.96□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W RPC31P17890 251 aa5.96□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W NGR1P32831 672 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W ARI1P53111 347 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W GAS4Q08271 471 aa5.95□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W MRP10O75012 95 aa5.94□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W HAP4P14064 554 aa5.94□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W SIS2P36024 562 aa5.94□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W KTR7P40504 517 aa5.94□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W IRC24P40580 263 aa5.94□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data5.93□□□□□ -1.46 RIP-Chip
SNX4YJL036W SFA1P32771 386 aa5.93□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W IDI1P15496 288 aa5.91□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W QDR2P40474 542 aa5.91□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W ROM1P53046 1155 aa5.9□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W SLP1Q12232 587 aa5.9□□□□□ -1.46
SNX4YJL036W ITC1P53125 1264 aa5.89□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W COQ2P32378 372 aa5.88□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W YKR073CP36153 106 aa5.88□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W YER156CP40093 338 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W RLF2Q12495 606 aa5.88□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W TRP3P00937 484 aa5.87□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W GAL2P13181 574 aa5.87□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W MED7Q08278 222 aa5.87□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W YLR122CQ12312 125 aa5.87□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W KAE1P36132 386 aa5.86□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W AVT1P47082 602 aa5.86□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa5.85□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W VAN1P23642 535 aa5.85□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W RSC6P25632 483 aa5.85□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa5.85□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W CAB1Q04430 367 aa5.84□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W YOR296WQ08748 1289 aa5.84□□□□□ -1.47
SNX4YJL036W TED1P40533 473 aa5.83□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W CWH41P53008 833 aa5.83□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W VMA3P25515 160 aa5.82□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W SUV3P32580 737 aa5.82□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W TOS1P38288 455 aa5.82□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W GIP2P40036 548 aa5.82□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W MRPL33P20084 86 aa5.81□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W SAF1P38352 637 aa5.81□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W BSD2P38356 321 aa5.81□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W CTH1P47976 325 aa5.81□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W TRS33Q99394 268 aa5.81□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data5.8□□□□□ -1.48not detected
SNX4YJL036W LIP5P32875 414 aa5.8□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W TGL4P36165 910 aa5.8□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W DYS1P38791 387 aa5.8□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W GIP1P38229 639 aa5.79□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W YGR130CP53278 816 aa5.79□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W CHS2P14180 963 aa5.78□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W TTI1P36097 1038 aa5.78□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W DSE4P53753 1117 aa5.78□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W ECM23Q02710 187 aa5.78□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W RSC2Q06488 889 aa5.78□□□□□ -1.48
SNX4YJL036W AOS1Q06624 347 aa5.77□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W BRE4Q07660 1125 aa5.77□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W NAM7P30771 971 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W LDH1P38139 375 aa5.76□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W YBR197CP38306 217 aa5.76□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W AKR1P39010 764 aa5.76□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W PPT1P53043 513 aa5.76□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data5.76□□□□□ -1.49not detected
SNX4YJL036W REC8Q12188 680 aa5.76□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W ISW1P38144 1129 aa5.75□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W YIL165CP40446 119 aa5.75□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W YJL181WP46987 611 aa5.75□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W ELM1P32801 640 aa5.74□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W MAG2Q06436 670 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W UBX7P38349 436 aa5.73□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W SPO74P45819 413 aa5.73□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W CYC7P00045 113 aa5.72□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W PAN5P38787 379 aa5.72□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W INP51P40559 946 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SNX4YJL036W MSN1P22148 382 aa5.71□□□□□ -1.5
SNX4YJL036W ISC10P32645 267 aa5.7□□□□□ -1.5
SNX4YJL036W ALD4P46367 519 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SNX4YJL036W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
SNX4YJL036W GUP1P53154 560 aa5.69□□□□□ -1.5
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