RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	6.31	□□□□□ -1.4
SYS1	YJL004C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	6.3	□□□□□ -1.4
SYS1	YJL004C	TAT1	P38085	619 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYS1	YJL004C	APM2	P38700	605 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYS1	YJL004C	PRK1	P40494	810 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYS1	YJL004C	ECM23	Q02710	187 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYS1	YJL004C	NHA1	Q99271	985 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SYS1	YJL004C	RPC31	P17890	251 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYS1	YJL004C	ALG14	P38242	237 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SYS1	YJL004C	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	QDR2	P40474	542 aa		6.27	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	UBX7	P38349	436 aa		6.26	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	CAB1	Q04430	367 aa		6.25	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.24	□□□□□ -1.41	not detected
SYS1	YJL004C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	DYS1	P38791	387 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	LSB6	P42951	607 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.24	□□□□□ -1.41	not detected
SYS1	YJL004C	GIS4	Q04233	774 aa		6.24	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	CPS1	P27614	576 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	SUV3	P32580	737 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	PRY1	P47032	299 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	YNR040W	P53736	256 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	MRPL33	P20084	86 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	MCA1	Q08601	432 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	YOR296W	Q08748	1289 aa		6.22	□□□□□ -1.41
SYS1	YJL004C	VMA3	P25515	160 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	PUP1	P25043	261 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	LDH1	P38139	375 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	BUD9	P53226	547 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	IDI1	P15496	288 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	GIP1	P38229	639 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	YBR197C	P38306	217 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	YPL034W	Q03083	165 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	SLP1	Q12232	587 aa		6.19	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	ITC1	P53125	1264 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	RSC2	Q06488	889 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	PUN1	Q06991	263 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	AI3	P03877	415 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	ISW1	P38144	1129 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	YBR287W	P38355	427 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	SRS2	P12954	1174 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	ISC10	P32645	267 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	RRM3	P38766	723 aa		6.16	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	SFA1	P32771	386 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	BSD2	P38356	321 aa		6.15	□□□□□ -1.42
SYS1	YJL004C	MRP10	O75012	95 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	SAC7	P17121	654 aa		6.13	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	MAC1	P35192	417 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	FIR1	P40020	876 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	YIL165C	P40446	119 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	MSN1	P22148	382 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	RRN6	P32786	894 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	GIP2	P40036	548 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	HXT8	P40886	569 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	PPT1	P53043	513 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	GAS5	Q08193	484 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SYS1	YJL004C	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	RSC6	P25632	483 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	TED1	P40533	473 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	DSE4	P53753	1117 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	YML083C	Q04526	418 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	COQ2	P32378	372 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	PNP1	Q05788	311 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	AIM46	P38885	310 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	LEM3	P42838	414 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	YJL181W	P46987	611 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	OMA1	P36163	345 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	GUP1	P53154	560 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	APC11	Q12157	165 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	KAE1	P36132	386 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SYS1	YJL004C	NTA1	P40354	457 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	INP52	P50942	1183 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	SOG2	Q08817	791 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	FUS1	P11710	512 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	SMC1	P32908	1225 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	SAF1	P38352	637 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYS1	YJL004C	PAN5	P38787	379 aa		6.01	□□□□□ -1.45

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