RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629943.2

PCBP1-AS1-355, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 725 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PRDM9Q9NQV7 894 aa8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MMP16P51512 607 aa8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 WIPF1O43516 503 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 WFS1O76024 890 aa8.42□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SMPD1P17405 629 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NLRP7Q8WX94 980 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 BCANQ96GW7 911 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TRIM32Q13049 653 aa8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 Q3C1V9 767 aa8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 DXOO77932 396 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CD46P15529 392 aa8.38□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.37□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 STK17AQ9UEE5 414 aa8.37□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TRIM47Q96LD4 638 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 LCE2CQ5TA81 110 aa8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SENP2Q9HC62 589 aa8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 J3QL48 77 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 WNT7BP56706 349 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 USP46P62068 366 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KDM4AO75164 1064 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MAP2K5Q13163 448 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KIFC2Q96AC6 838 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SKOR1P84550 965 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 HPS1Q92902 700 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 HOXA2O43364 376 aa8.28□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 IRF6O14896 467 aa8.27□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SIAH2O43255 324 aa8.26□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 JUNDP17535 347 aa8.25□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 HLA-CQ95604 372 aa8.25□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.24□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NPAS3Q8IXF0 933 aa8.24□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RETREG3Q86VR2 466 aa8.22□□□□□ -1.09
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.21□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ALDH1A1P00352 501 aa8.2□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.19□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.19□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.19□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CLCN1P35523 988 aa8.18□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GUCA2AQ02747 115 aa8.18□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.18□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MPNDQ8N594 471 aa8.17□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CCDC102AQ96A19 550 aa8.17□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SH3BP2P78314 561 aa8.16□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 EHBP1Q8NDI1 1231 aa8.15□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PCDHGC3Q9UN70 934 aa8.15□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.14□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 H3BM21 787 aa8.14□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.14□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PTPRNQ16849 979 aa8.14□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 IRF7Q92985 503 aa8.14□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.14□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 BMP1P13497 986 aa8.13□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GMPRP36959 345 aa8.13□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FDX1P10109 184 aa8.12□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MS4A1P11836 297 aa8.12□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 DESI1Q6ICB0 168 aa8.12□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.12□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.12□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa8.11□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 UNC93B1Q9H1C4 597 aa8.1□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 VSIG8P0DPA2 414 aa8.09□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KCNH2Q12809 1159 aa8.09□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ERBB4Q15303 1308 aa8.08□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PLEKHG3A1L390 1219 aa8.08□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 C6orf229H3BNL8 230 aa8.08□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZNF511Q8NB15 262 aa8.08□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.08□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZFP42Q96MM3 310 aa8.08□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.07□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GJA5P36382 358 aa8.07□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 BAP1Q92560 729 aa8.06□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.06□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms