RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597330.1

LETM1P2-201, Transcript of leucine zipper and EF-hand containing transmembrane protein 1 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene LETM1P2, Length 2,178 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1P2-201ENST00000597330 KANK1Q14678 1352 aa23.63■■□□□ 1.37
LETM1P2-201ENST00000597330 ATP10AO60312 1499 aa23.63■■□□□ 1.37
LETM1P2-201ENST00000597330 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
LETM1P2-201ENST00000597330 IGHDP01880 384 aa23.61■■□□□ 1.37
LETM1P2-201ENST00000597330 GOLGA2Q08379 1002 aa23.61■■□□□ 1.37
LETM1P2-201ENST00000597330 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.61■■□□□ 1.37
LETM1P2-201ENST00000597330 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.61■■□□□ 1.37
LETM1P2-201ENST00000597330 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
LETM1P2-201ENST00000597330 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.59■■□□□ 1.37
LETM1P2-201ENST00000597330 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.59■■□□□ 1.37
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LETM1P2-201ENST00000597330 GGT6Q6P531 493 aa23.59■■□□□ 1.37
LETM1P2-201ENST00000597330 TESK2Q96S53 571 aa23.59■■□□□ 1.37
LETM1P2-201ENST00000597330 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.58■■□□□ 1.37
LETM1P2-201ENST00000597330 TERF1P54274 439 aa23.58■■□□□ 1.36
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LETM1P2-201ENST00000597330 PANK3Q9H999 370 aa23.58■■□□□ 1.36
LETM1P2-201ENST00000597330 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.58■■□□□ 1.36
LETM1P2-201ENST00000597330 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.57■■□□□ 1.36
LETM1P2-201ENST00000597330 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.57■■□□□ 1.36
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LETM1P2-201ENST00000597330 MAP7D2Q96T17 732 aa23.57■■□□□ 1.36
LETM1P2-201ENST00000597330 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.56■■□□□ 1.36
LETM1P2-201ENST00000597330 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.56■■□□□ 1.36
LETM1P2-201ENST00000597330 TMF1P82094 1093 aa23.55■■□□□ 1.36
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LETM1P2-201ENST00000597330 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.55■■□□□ 1.36
LETM1P2-201ENST00000597330 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
LETM1P2-201ENST00000597330 REREQ9P2R6 1566 aa23.54■■□□□ 1.36
LETM1P2-201ENST00000597330 RGL3Q3MIN7 710 aa23.53■■□□□ 1.36
LETM1P2-201ENST00000597330 TET3O43151 1660 aa23.52■■□□□ 1.36
LETM1P2-201ENST00000597330 PLA2R1Q13018 1463 aa23.52■■□□□ 1.36
LETM1P2-201ENST00000597330 AAMPQ13685 434 aa23.51■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 OFD1O75665 1012 aa23.51■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 CEP152O94986 1710 aa23.5■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 PDE3AQ14432 1141 aa23.5■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 CLUAP1Q96AJ1 413 aa23.5■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 AGLP35573 1532 aa23.49■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.48■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.47■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 RIPK4P57078 832 aa23.47■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 CCDC173Q0VFZ6 552 aa23.46■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 ABCC3O15438 1527 aa23.46■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.45■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.45■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 PPP1R9BQ96SB3 815 aa23.45■■□□□ 1.35
LETM1P2-201ENST00000597330 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.45■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa23.45■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 BCAR3O75815 825 aa23.44■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.43■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa23.42■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 PTMSP20962 102 aa23.41■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 MLECQ14165 292 aa23.41■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 PPP2R1AP30153 589 aa23.41■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.41■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.39■■□□□ 1.34
LETM1P2-201ENST00000597330 DDIT3P35638 169 aa23.39■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.39■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 PTPRTO14522 1441 aa23.39■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 E9PSI1 815 aa23.38■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 TRPM2O94759 1503 aa23.37■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 NPATQ14207 1427 aa23.37■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 FGD1P98174 961 aa23.37■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 C22orf23Q9BZE7 217 aa23.37■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.36■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 PIK3C2GO75747 1445 aa23.36■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 CDCA8Q53HL2 280 aa23.35■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 HSCBQ8IWL3 235 aa23.35■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.34■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 COG6Q9Y2V7 657 aa23.34■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 GBP4Q96PP9 640 aa23.34■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
LETM1P2-201ENST00000597330 FAM13BQ9NYF5 915 aa23.33■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 SYNMO15061 1565 aa23.32■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 HS1BP3Q53T59 392 aa23.32■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.31■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 PANK1Q8TE04 598 aa23.31■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.31■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 NGEFQ8N5V2 710 aa23.31■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 CLTCL1P53675 1640 aa23.31■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.3■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 IQGAP1P46940 1657 aa23.3■■□□□ 1.32
LETM1P2-201ENST00000597330 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
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