RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA2Q08379 1002 aa21.77■■□□□ 1.08
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NGEFQ8N5V2 710 aa21.76■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.76■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPRMP28827 1452 aa21.75■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NSD2O96028 1365 aa21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MORC1Q86VD1 984 aa21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NINLQ9Y2I6 1382 aa21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.73■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLFN5Q08AF3 891 aa21.73■■□□□ 1.07
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.72■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ALKQ9UM73 1620 aa21.72■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 APAF1O14727 1248 aa21.71■■□□□ 1.07
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CABP2Q9NPB3 220 aa21.66■■□□□ 1.06
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CRBNQ96SW2 442 aa21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.65■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IQSEC2Q5JU85 1478 aa21.64■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ABCC11Q96J66 1382 aa21.64■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 E9PSI1 815 aa21.64■■□□□ 1.06
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STK26Q9P289 416 aa21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DLC1Q96QB1 1528 aa21.64■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1W2PP64 1363 aa21.63■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MTHFSP49914 203 aa21.61■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRAM1Q96QH2 718 aa21.61■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.61■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RUNDC1Q96C34 613 aa21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFAP53Q96M91 514 aa21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MED14O60244 1454 aa21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.6■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.59■■□□□ 1.05
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.56■■□□□ 1.04
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NLRP1Q9C000 1473 aa21.55■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.55■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MS4A1P11836 297 aa21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC27Q2M243 656 aa21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.52■■□□□ 1.04
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.51■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDK19Q9BWU1 502 aa21.51■■□□□ 1.03
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WDR63Q8IWG1 891 aa21.5■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZMYM3Q14202 1370 aa21.5■■□□□ 1.03
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP7BP35670 1465 aa21.49■■□□□ 1.03
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BCAR3O75815 825 aa21.47■■□□□ 1.03
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NEUROD2Q15784 382 aa21.44■■□□□ 1.02
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PDE3AQ14432 1141 aa21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CABP1Q9NZU7 370 aa21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PDE4AP27815 886 aa21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TECPR2O15040 1411 aa21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BACH2Q9BYV9 841 aa21.42■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CPS1P31327 1500 aa21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.41■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 METP08581 1390 aa21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNRQ92752 1358 aa21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.4■■□□□ 1.02
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
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