RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 KIFC2Q96AC6 838 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 SEMA3EO15041 775 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 GNPATO15228 680 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM32Q13049 653 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 FECHP22830 423 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 Q3C1V9 767 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 J3QL48 77 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 MMP16P51512 607 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 LCE2CQ5TA81 110 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRM-204ENST00000577468 HPS1Q92902 700 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 WNT7BP56706 349 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 GPR37O15354 613 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 NLRP7Q8WX94 980 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 SLC24A1O60721 1099 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 PHOX2BQ99453 314 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 IRF7Q92985 503 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRM-204ENST00000577468 KDM4AO75164 1064 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 ALDH1A1P00352 501 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 USP46P62068 366 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 SKOR1P84550 965 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 CD46P15529 392 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 GMPRP36959 345 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 SIAH2O43255 324 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 H3BM21 787 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 JUNDP17535 347 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM46Q7Z4K8 759 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 EHBP1Q8NDI1 1231 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 WASF2Q9Y6W5 498 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRM-204ENST00000577468 BMP1P13497 986 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 GPIHBP1Q8IV16 184 aa5.96□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 HOXA2O43364 376 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 NUDT12Q9BQG2 462 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 RETREG3Q86VR2 466 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 HLA-CQ95604 372 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 VEGFBP49765 207 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 MAP2K5Q13163 448 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP42Q96MM3 310 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 ERBB4Q15303 1308 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHG3A1L390 1219 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 SH3BP2P78314 561 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 MPNDQ8N594 471 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 IRF6O14896 467 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 SCARF1Q14162 830 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 CCNYL3P0C7X3 344 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 VSIG8P0DPA2 414 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 MS4A1P11836 297 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 GUCA2AQ02747 115 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 NUTM1Q86Y26 1132 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-204ENST00000577468 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 VARSP26640 1264 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 EVA1BQ9NVM1 165 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 CLCN1P35523 988 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 PTPRNQ16849 979 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 GPCPD1Q9NPB8 672 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 C6orf229H3BNL8 230 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 FDX1P10109 184 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 KCNMA1Q12791 1236 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 NNTQ13423 1086 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 UNC93B1Q9H1C4 597 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 ADH1CP00326 375 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 KCNH2Q12809 1159 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF511Q8NB15 262 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 BAP1Q92560 729 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 TLL2Q9Y6L7 1015 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 TIMP2P16035 220 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 WDR4P57081 412 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHGC3Q9UN70 934 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01559Q495D7 138 aa5.84□□□□□ -1.47
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