RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1-211ENST00000567434 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.91■■□□□ 1.58
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLC1Q96QB1 1528 aa24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-211ENST00000567434 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRB1O14514 1584 aa24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHPRHQ149N8 1683 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 ORAI2Q96SN7 254 aa24.79■■□□□ 1.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAM1Q96QH2 718 aa24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRP6O75581 1613 aa24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1-211ENST00000567434 POGKQ9P215 609 aa24.76■■□□□ 1.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADGRB2O60241 1585 aa24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.73■■□□□ 1.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIF1AQ12756 1690 aa24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-211ENST00000567434 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 PXDNQ92626 1479 aa24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUTM2FA1L443 756 aa24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOXO3O43524 673 aa24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.64■■□□□ 1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.62■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEUROD1Q13562 356 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.61■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 RXRBP28702 533 aa24.6■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP32Q8NFA0 1604 aa24.6■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSME1Q06323 249 aa24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 AFF2P51816 1311 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 SBNO1A3KN83 1393 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.52■■□□□ 1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITSN1Q15811 1721 aa24.52■■□□□ 1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.52■■□□□ 1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 C8orf37Q96NL8 207 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP7BP35670 1465 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAMTS2O95450 1211 aa24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGEF10O15013 1369 aa24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 TONSLQ96HA7 1378 aa24.49■■□□□ 1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.48■■□□□ 1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 NGLY1Q96IV0 654 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDK19Q9BWU1 502 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 RGS12O14924 1447 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 USP21Q9UK80 565 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALS2Q96Q42 1657 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ABCA3Q99758 1704 aa24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 EVC2Q86UK5 1308 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATRNO75882 1429 aa24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms