RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.97■■□□□ 1.59
CCNDBP1-204ENST00000563065 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.96■■□□□ 1.59
CCNDBP1-204ENST00000563065 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-204ENST00000563065 DLC1Q96QB1 1528 aa24.94■■□□□ 1.58
CCNDBP1-204ENST00000563065 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.92■■□□□ 1.58
CCNDBP1-204ENST00000563065 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-204ENST00000563065 DCCP43146 1447 aa24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-204ENST00000563065 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUTM2FA1L443 756 aa24.89■■□□□ 1.57
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
CCNDBP1-204ENST00000563065 MST1RQ04912 1400 aa24.88■■□□□ 1.57
CCNDBP1-204ENST00000563065 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.87■■□□□ 1.57
CCNDBP1-204ENST00000563065 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.86■■□□□ 1.57
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSPA1LP34931 641 aa24.85■■□□□ 1.57
CCNDBP1-204ENST00000563065 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.84■■□□□ 1.57
CCNDBP1-204ENST00000563065 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.83■■□□□ 1.57
CCNDBP1-204ENST00000563065 BRINP3Q76B58 766 aa24.83■■□□□ 1.56
CCNDBP1-204ENST00000563065 ORAI2Q96SN7 254 aa24.83■■□□□ 1.56
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.82■■□□□ 1.56
CCNDBP1-204ENST00000563065 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CCNDBP1-204ENST00000563065 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CCNDBP1-204ENST00000563065 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CCNDBP1-204ENST00000563065 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.77■■□□□ 1.56
CCNDBP1-204ENST00000563065 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.76■■□□□ 1.55
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDK19Q9BWU1 502 aa24.75■■□□□ 1.55
CCNDBP1-204ENST00000563065 ADGRB2O60241 1585 aa24.74■■□□□ 1.55
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1-204ENST00000563065 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1-204ENST00000563065 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
CCNDBP1-204ENST00000563065 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CCNDBP1-204ENST00000563065 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP32Q8NFA0 1604 aa24.69■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 FOXO3O43524 673 aa24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 CABP2Q9NPB3 220 aa24.68■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 PHLPP1O60346 1717 aa24.67■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP47Q96K76 1375 aa24.66■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
CCNDBP1-204ENST00000563065 EVC2Q86UK5 1308 aa24.63■■□□□ 1.53
CCNDBP1-204ENST00000563065 TESK2Q96S53 571 aa24.63■■□□□ 1.53
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP7BP35670 1465 aa24.62■■□□□ 1.53
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CCNDBP1-204ENST00000563065 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.62■■□□□ 1.53
CCNDBP1-204ENST00000563065 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-204ENST00000563065 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.59■■□□□ 1.53
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-204ENST00000563065 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.58■■□□□ 1.53
CCNDBP1-204ENST00000563065 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.57■■□□□ 1.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 PXDNQ92626 1479 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 KIF1AQ12756 1690 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 PSME1Q06323 249 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 CABP1Q9NZU7 370 aa24.55■■□□□ 1.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 JCADQ9P266 1359 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.53■■□□□ 1.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.52■■□□□ 1.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 ACEP12821 1306 aa24.52■■□□□ 1.52
CCNDBP1-204ENST00000563065 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.51■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.51■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ITSN1Q15811 1721 aa24.5■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMF1P82094 1093 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.47■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMC1Q8TDI8 760 aa24.45■■□□□ 1.51
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLEKHG5O94827 1062 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-204ENST00000563065 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1-204ENST00000563065 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1-204ENST00000563065 SHPRHQ149N8 1683 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-204ENST00000563065 SLC24A1O60721 1099 aa24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-204ENST00000563065 SBNO1A3KN83 1393 aa24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-204ENST00000563065 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-204ENST00000563065 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-204ENST00000563065 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRP6O75581 1613 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP6P35125 1406 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-204ENST00000563065 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms