RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557495.5

ZNF410-222, Transcript of zinc finger protein 410, human

TSL 4

Gene ZNF410, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF410-222	ENST00000557495	PHLPP1	O60346	1717 aa		12.16	□□□□□ -0.46
ZNF410-222	ENST00000557495	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		12.15	□□□□□ -0.46
ZNF410-222	ENST00000557495	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		12.14	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		12.14	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	12.13	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	ILDR2	Q71H61	639 aa		12.12	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	BRINP3	Q76B58	766 aa		12.12	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	STAC3	Q96MF2	364 aa		12.12	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		12.12	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		12.12	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		12.12	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	DLC1	Q96QB1	1528 aa		12.11	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		12.11	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		12.11	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		12.11	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	12.11	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		12.11	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	12.11	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	PRAM1	Q96QH2	718 aa		12.1	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		12.1	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	NUTM2F	A1L443	756 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	SIRT1	Q96EB6	747 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	ORAI2	Q96SN7	254 aa		12.09	□□□□□ -0.47
ZNF410-222	ENST00000557495	POGK	Q9P215	609 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ZNF410-222	ENST00000557495	USP32	Q8NFA0	1604 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ZNF410-222	ENST00000557495	ADGRB2	O60241	1585 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ZNF410-222	ENST00000557495	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ZNF410-222	ENST00000557495	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ZNF410-222	ENST00000557495	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
ZNF410-222	ENST00000557495	SHPRH	Q149N8	1683 aa		12.04	□□□□□ -0.48
ZNF410-222	ENST00000557495	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ZNF410-222	ENST00000557495	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ZNF410-222	ENST00000557495	TONSL	Q96HA7	1378 aa		12.03	□□□□□ -0.48
ZNF410-222	ENST00000557495	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	JCAD	Q9P266	1359 aa		12.02	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	KIF1A	Q12756	1690 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	PXDN	Q92626	1479 aa		12.01	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	LRP6	O75581	1613 aa		12	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	FOXO3	O43524	673 aa		12	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		11.98	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	ITSN1	Q15811	1721 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	ATP7B	P35670	1465 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	CDK19	Q9BWU1	502 aa		11.96	□□□□□ -0.49
ZNF410-222	ENST00000557495	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		11.94	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		11.93	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	CABP2	Q9NPB3	220 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	ABCA3	Q99758	1704 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	ALS2	Q96Q42	1657 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	PSME1	Q06323	249 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	ADAMTS2	O95450	1211 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	POTEA	Q6S8J7	498 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ZNF410-222	ENST00000557495	PLEKHG5	O94827	1062 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ZNF410-222	ENST00000557495	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
ZNF410-222	ENST00000557495	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ZNF410-222	ENST00000557495	SBNO1	A3KN83	1393 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ZNF410-222	ENST00000557495	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF410-222	ENST00000557495	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF410-222	ENST00000557495	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
ZNF410-222	ENST00000557495	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF410-222	ENST00000557495	ACE	P12821	1306 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ZNF410-222	ENST00000557495	EVC2	Q86UK5	1308 aa		11.87	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms