RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6-202ENST00000550078 PLS1Q14651 629 aa6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 TEFQ10587 303 aa6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 WASHC4Q2M389 1173 aa6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 ITPRIPQ8IWB1 547 aa6.38□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 SEC24BO95487 1268 aa6.37□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 TRIM29Q14134 588 aa6.37□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF76P36508 570 aa6.37□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 SYCP1Q15431 976 aa6.37□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 ERICH2A1L162 156 aa6.37□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC181Q5TID7 509 aa6.37□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 ANAPC15P60006 121 aa6.37□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 AAMPQ13685 434 aa6.37□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP6.37□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 KIF20AO95235 890 aa6.36□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.36□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.36□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.36□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF592Q92610 1267 aa6.36□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.36□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 HSCBQ8IWL3 235 aa6.36□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.36□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 BANK1Q8NDB2 785 aa6.35□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 FEZ1Q99689 392 aa6.35□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.35□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa6.35□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.35□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.35□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 DNAJC13O75165 2243 aa6.35□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.34□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 CPLX1O14810 134 aa6.34□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 PRKG1Q13976 671 aa6.34□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 DPH6Q7L8W6 267 aa6.34□□□□□ -1.39
ZBED6-202ENST00000550078 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TRDNQ13061 729 aa6.34□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.34□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 SPATA17Q96L03 361 aa6.34□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TPM1P09493 284 aa6.33□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.33□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 NOD1Q9Y239 953 aa6.33□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.33□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.33□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 SOGA3Q5TF21 947 aa6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 LPXNO60711 386 aa6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 KIF16BQ96L93 1317 aa6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 MAP7D2Q96T17 732 aa6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 NF2P35240 595 aa6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 PPM1EQ8WY54 764 aa6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TNNT1P13805 278 aa6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 PPFIA1Q13136 1202 aa6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TMCO4Q5TGY1 634 aa6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.31□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 RDXP35241 583 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 FAM69CQ0P6D2 419 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 DCAF11Q8TEB1 546 aa6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ZBED6-202ENST00000550078 RIMBP2O15034 1052 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms