RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.57
CS-216ENST00000549221 FAM135BQ49AJ0 1406 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 TULP4Q9NRJ4 1543 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 SIRT1Q96EB6 747 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 POGKQ9P215 609 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 CCDC7Q96M83 1385 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 ADGRB2O60241 1585 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 NALCNQ8IZF0 1738 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-216ENST00000549221 TMF1P82094 1093 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 LRRC7Q96NW7 1537 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 POLR3GLQ9BT43 218 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 CABP2Q9NPB3 220 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 TMEM94Q12767 1356 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 MYOM1P52179 1685 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 CDK19Q9BWU1 502 aa11.36□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 EVC2Q86UK5 1308 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 PRR36Q9H6K5 1346 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 WASLO00401 505 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 USP32Q8NFA0 1604 aa11.35□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 ATP7BP35670 1465 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-216ENST00000549221 FMN2Q9NZ56 1722 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 NUTM2FA1L443 756 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 SLC24A1O60721 1099 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 CDCA8Q53HL2 280 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 C14orf37Q86TY3 774 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 CD163L1Q9NR16 1453 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 ATAD2Q6PL18 1390 aa11.3□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 C19orf44Q9H6X5 657 aa11.29□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 DCCP43146 1447 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 MST1RQ04912 1400 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 TMC1Q8TDI8 760 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 CABP1Q9NZU7 370 aa11.28□□□□□ -0.6
CS-216ENST00000549221 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 CARD14Q9BXL6 1004 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 PANK3Q9H999 370 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PP64 1363 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 MSH6P52701 1360 aa11.27□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 NINLQ9Y2I6 1382 aa11.26□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 ITSN1Q15811 1721 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa11.25□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 ATF3P18847 181 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 ORAI2Q96SN7 254 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 NSD3Q9BZ95 1437 aa11.24□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 AKAP12Q02952 1782 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 CADPS2Q86UW7 1296 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 ACEP12821 1306 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 MON2Q7Z3U7 1717 aa11.23□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 NRKQ7Z2Y5 1582 aa11.22□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 USP6P35125 1406 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 ESCO1Q5FWF5 840 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.21□□□□□ -0.61
CS-216ENST00000549221 SSH2Q76I76 1423 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 HSPA1LP34931 641 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 TERF2IPQ9NYB0 399 aa11.2□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 BRINP3Q76B58 766 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 SLAIN2Q9P270 581 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 KIF1AQ12756 1690 aa11.19□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 FOXO3O43524 673 aa11.18□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
CS-216ENST00000549221 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
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