RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546023.1

TCP1-217, Transcript of t-complex 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TCP1, Length 1,135 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1-217ENST00000546023 NHSL1Q5SYE7 1610 aa36.78■■■■□ 3.48
TCP1-217ENST00000546023 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.76■■■■□ 3.47
TCP1-217ENST00000546023 SIRT1Q96EB6 747 aa36.73■■■■□ 3.47
TCP1-217ENST00000546023 SIN3AQ96ST3 1273 aa36.71■■■■□ 3.47
TCP1-217ENST00000546023 FMN2Q9NZ56 1722 aa36.71■■■■□ 3.47
TCP1-217ENST00000546023 PRAM1Q96QH2 718 aa36.68■■■■□ 3.46
TCP1-217ENST00000546023 JCADQ9P266 1359 aa36.67■■■■□ 3.46
TCP1-217ENST00000546023 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP36.67■■■■□ 3.46
TCP1-217ENST00000546023 ADGRB2O60241 1585 aa36.66■■■■□ 3.46
TCP1-217ENST00000546023 NEUROD1Q13562 356 aa36.65■■■■□ 3.46
TCP1-217ENST00000546023 SHPRHQ149N8 1683 aa36.64■■■■□ 3.46
TCP1-217ENST00000546023 TRAK1Q9UPV9 953 aa36.64■■■■□ 3.46
TCP1-217ENST00000546023 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.62■■■■□ 3.45
TCP1-217ENST00000546023 POGKQ9P215 609 aa36.62■■■■□ 3.45
TCP1-217ENST00000546023 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP36.61■■■■□ 3.45
TCP1-217ENST00000546023 ORAI2Q96SN7 254 aa36.59■■■■□ 3.45
TCP1-217ENST00000546023 KIF1AQ12756 1690 aa36.55■■■■□ 3.44
TCP1-217ENST00000546023 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
TCP1-217ENST00000546023 NUTM2FA1L443 756 aa36.54■■■■□ 3.44
TCP1-217ENST00000546023 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
TCP1-217ENST00000546023 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.54■■■■□ 3.44
TCP1-217ENST00000546023 ESCO1Q5FWF5 840 aa36.52■■■■□ 3.44
TCP1-217ENST00000546023 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa36.49■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.48■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 TONSLQ96HA7 1378 aa36.47■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 ANKARQ7Z5J8 1434 aa36.47■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 USP32Q8NFA0 1604 aa36.47■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP36.46■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 LRP6O75581 1613 aa36.46■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 NPHP3Q7Z494 1330 aa36.46■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP36.45■■■■□ 3.43
TCP1-217ENST00000546023 TULP4Q9NRJ4 1543 aa36.44■■■■□ 3.42
TCP1-217ENST00000546023 PXDNQ92626 1479 aa36.44■■■■□ 3.42
TCP1-217ENST00000546023 PNPLA6Q8IY17 1366 aa36.42■■■■□ 3.42
TCP1-217ENST00000546023 PCGF6Q9BYE7 350 aa36.42■■■■□ 3.42
TCP1-217ENST00000546023 ILDR2Q71H61 639 aa36.39■■■■□ 3.42
TCP1-217ENST00000546023 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
TCP1-217ENST00000546023 FOXO3O43524 673 aa36.37■■■■□ 3.41
TCP1-217ENST00000546023 QRICH2Q9H0J4 1663 aa36.36■■■■□ 3.41
TCP1-217ENST00000546023 WASLO00401 505 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
TCP1-217ENST00000546023 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP36.34■■■■□ 3.41
TCP1-217ENST00000546023 PHF8Q9UPP1 1060 aa36.34■■■■□ 3.41
TCP1-217ENST00000546023 ITSN1Q15811 1721 aa36.33■■■■□ 3.41
TCP1-217ENST00000546023 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 ATP7BP35670 1465 aa36.31■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 PRR36Q9H6K5 1346 aa36.3■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 RALGAPBQ86X10 1494 aa36.3■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 NBPF8Q3BBV2 869 aa36.29■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.27■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa36.26■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
TCP1-217ENST00000546023 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa36.22■■■■□ 3.39
TCP1-217ENST00000546023 TNS3Q68CZ2 1445 aa36.22■■■■□ 3.39
TCP1-217ENST00000546023 KRT28Q7Z3Y7 464 aa36.21■■■■□ 3.39
TCP1-217ENST00000546023 CDK19Q9BWU1 502 aa36.2■■■■□ 3.39
TCP1-217ENST00000546023 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.19■■■■□ 3.38
TCP1-217ENST00000546023 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa36.18■■■■□ 3.38
TCP1-217ENST00000546023 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
TCP1-217ENST00000546023 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
TCP1-217ENST00000546023 SBNO1A3KN83 1393 aa36.16■■■■□ 3.38
TCP1-217ENST00000546023 PSME1Q06323 249 aa36.16■■■■□ 3.38
TCP1-217ENST00000546023 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.13■■■■□ 3.37
TCP1-217ENST00000546023 POTEAQ6S8J7 498 aa36.11■■■■□ 3.37
TCP1-217ENST00000546023 ADAMTS2O95450 1211 aa36.1■■■■□ 3.37
TCP1-217ENST00000546023 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
TCP1-217ENST00000546023 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
TCP1-217ENST00000546023 ARHGEF10O15013 1369 aa36.1■■■■□ 3.37
TCP1-217ENST00000546023 ABCA3Q99758 1704 aa36.09■■■■□ 3.37
TCP1-217ENST00000546023 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
TCP1-217ENST00000546023 C8orf37Q96NL8 207 aa36.09■■■■□ 3.37
TCP1-217ENST00000546023 ALS2Q96Q42 1657 aa36.09■■■■□ 3.37
TCP1-217ENST00000546023 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
TCP1-217ENST00000546023 AFF2P51816 1311 aa36.07■■■■□ 3.36
TCP1-217ENST00000546023 CCDC61Q9Y6R9 512 aa36.06■■■■□ 3.36
TCP1-217ENST00000546023 EVC2Q86UK5 1308 aa36.05■■■■□ 3.36
TCP1-217ENST00000546023 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
TCP1-217ENST00000546023 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa36.04■■■■□ 3.36
TCP1-217ENST00000546023 CABP2Q9NPB3 220 aa36.04■■■■□ 3.36
TCP1-217ENST00000546023 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa36.03■■■■□ 3.36
TCP1-217ENST00000546023 SOCS7O14512 581 aa36.02■■■■□ 3.36
TCP1-217ENST00000546023 LMOD2Q6P5Q4 547 aa36.02■■■■□ 3.36
TCP1-217ENST00000546023 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
TCP1-217ENST00000546023 NGLY1Q96IV0 654 aa35.99■■■■□ 3.35
TCP1-217ENST00000546023 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.98■■■■□ 3.35
TCP1-217ENST00000546023 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.98■■■■□ 3.35
TCP1-217ENST00000546023 ACEP12821 1306 aa35.98■■■■□ 3.35
TCP1-217ENST00000546023 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
TCP1-217ENST00000546023 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.94■■■■□ 3.34
TCP1-217ENST00000546023 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
TCP1-217ENST00000546023 PLEKHG5O94827 1062 aa35.92■■■■□ 3.34
TCP1-217ENST00000546023 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.9 ms