RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542720.1

LATS1-205, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LATS1, Length 1,096 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-205ENST00000542720 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.32■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 SIRT1Q96EB6 747 aa25.3■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.29■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.29■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 ATF3P18847 181 aa25.29■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 PRAM1Q96QH2 718 aa25.29■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.29■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 SLAIN2Q9P270 581 aa25.28■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 JCADQ9P266 1359 aa25.28■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.27■■□□□ 1.64
LATS1-205ENST00000542720 POGKQ9P215 609 aa25.25■■□□□ 1.63
LATS1-205ENST00000542720 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.24■■□□□ 1.63
LATS1-205ENST00000542720 DLC1Q96QB1 1528 aa25.24■■□□□ 1.63
LATS1-205ENST00000542720 DCCP43146 1447 aa25.21■■□□□ 1.63
LATS1-205ENST00000542720 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
LATS1-205ENST00000542720 MST1RQ04912 1400 aa25.19■■□□□ 1.62
LATS1-205ENST00000542720 LRP6O75581 1613 aa25.18■■□□□ 1.62
LATS1-205ENST00000542720 NUTM2FA1L443 756 aa25.17■■□□□ 1.62
LATS1-205ENST00000542720 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.17■■□□□ 1.62
LATS1-205ENST00000542720 PHLPP1O60346 1717 aa25.17■■□□□ 1.62
LATS1-205ENST00000542720 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
LATS1-205ENST00000542720 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LATS1-205ENST00000542720 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LATS1-205ENST00000542720 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
LATS1-205ENST00000542720 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.15■■□□□ 1.62
LATS1-205ENST00000542720 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
LATS1-205ENST00000542720 BRINP3Q76B58 766 aa25.13■■□□□ 1.61
LATS1-205ENST00000542720 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.13■■□□□ 1.61
LATS1-205ENST00000542720 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.13■■□□□ 1.61
LATS1-205ENST00000542720 ORAI2Q96SN7 254 aa25.12■■□□□ 1.61
LATS1-205ENST00000542720 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.12■■□□□ 1.61
LATS1-205ENST00000542720 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.12■■□□□ 1.61
LATS1-205ENST00000542720 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.12■■□□□ 1.61
LATS1-205ENST00000542720 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
LATS1-205ENST00000542720 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
LATS1-205ENST00000542720 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.07■■□□□ 1.6
LATS1-205ENST00000542720 RXRBP28702 533 aa25.07■■□□□ 1.6
LATS1-205ENST00000542720 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
LATS1-205ENST00000542720 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
LATS1-205ENST00000542720 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.06■■□□□ 1.6
LATS1-205ENST00000542720 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.05■■□□□ 1.6
LATS1-205ENST00000542720 ADGRB2O60241 1585 aa25.05■■□□□ 1.6
LATS1-205ENST00000542720 CDK19Q9BWU1 502 aa25.02■■□□□ 1.6
LATS1-205ENST00000542720 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
LATS1-205ENST00000542720 PRR36Q9H6K5 1346 aa25.01■■□□□ 1.59
LATS1-205ENST00000542720 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
LATS1-205ENST00000542720 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
LATS1-205ENST00000542720 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25■■□□□ 1.59
LATS1-205ENST00000542720 USP32Q8NFA0 1604 aa24.98■■□□□ 1.59
LATS1-205ENST00000542720 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
LATS1-205ENST00000542720 FOXO3O43524 673 aa24.96■■□□□ 1.59
LATS1-205ENST00000542720 SHPRHQ149N8 1683 aa24.96■■□□□ 1.59
LATS1-205ENST00000542720 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.96■■□□□ 1.59
LATS1-205ENST00000542720 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa24.95■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 CABP2Q9NPB3 220 aa24.95■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.95■■□□□ 1.58
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LATS1-205ENST00000542720 ANKARQ7Z5J8 1434 aa24.95■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 AFF2P51816 1311 aa24.93■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.93■■□□□ 1.58
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LATS1-205ENST00000542720 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 ATP7BP35670 1465 aa24.9■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.89■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 EVC2Q86UK5 1308 aa24.89■■□□□ 1.58
LATS1-205ENST00000542720 USP47Q96K76 1375 aa24.89■■□□□ 1.57
LATS1-205ENST00000542720 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.87■■□□□ 1.57
LATS1-205ENST00000542720 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
LATS1-205ENST00000542720 TESK2Q96S53 571 aa24.87■■□□□ 1.57
LATS1-205ENST00000542720 KIF1AQ12756 1690 aa24.87■■□□□ 1.57
LATS1-205ENST00000542720 RGS12O14924 1447 aa24.86■■□□□ 1.57
LATS1-205ENST00000542720 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.86■■□□□ 1.57
LATS1-205ENST00000542720 PXDNQ92626 1479 aa24.85■■□□□ 1.57
LATS1-205ENST00000542720 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.85■■□□□ 1.57
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LATS1-205ENST00000542720 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
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LATS1-205ENST00000542720 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
LATS1-205ENST00000542720 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.81■■□□□ 1.56
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LATS1-205ENST00000542720 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.8■■□□□ 1.56
LATS1-205ENST00000542720 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.8■■□□□ 1.56
LATS1-205ENST00000542720 ITSN1Q15811 1721 aa24.8■■□□□ 1.56
LATS1-205ENST00000542720 ACEP12821 1306 aa24.8■■□□□ 1.56
LATS1-205ENST00000542720 C8orf37Q96NL8 207 aa24.79■■□□□ 1.56
LATS1-205ENST00000542720 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.79■■□□□ 1.56
LATS1-205ENST00000542720 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.77■■□□□ 1.56
LATS1-205ENST00000542720 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
LATS1-205ENST00000542720 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
LATS1-205ENST00000542720 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
LATS1-205ENST00000542720 LMOD2Q6P5Q4 547 aa24.73■■□□□ 1.55
LATS1-205ENST00000542720 SBNO1A3KN83 1393 aa24.72■■□□□ 1.55
LATS1-205ENST00000542720 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.72■■□□□ 1.55
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