RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 RXRBP28702 533 aa22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1-206ENST00000520462 PTCH1Q13635 1447 aa22.36■■□□□ 1.17
TSNARE1-206ENST00000520462 C1orf167Q5SNV9 1468 aa22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1-206ENST00000520462 AFF2P51816 1311 aa22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1-206ENST00000520462 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.35■■□□□ 1.17
TSNARE1-206ENST00000520462 C8orf37Q96NL8 207 aa22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-206ENST00000520462 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TSNARE1-206ENST00000520462 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-206ENST00000520462 PNPLA6Q8IY17 1366 aa22.33■■□□□ 1.17
TSNARE1-206ENST00000520462 NEUROD1Q13562 356 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-206ENST00000520462 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-206ENST00000520462 ORAI2Q96SN7 254 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-206ENST00000520462 STK26Q9P289 416 aa22.32■■□□□ 1.16
TSNARE1-206ENST00000520462 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.31■■□□□ 1.16
TSNARE1-206ENST00000520462 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-206ENST00000520462 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.3■■□□□ 1.16
TSNARE1-206ENST00000520462 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-206ENST00000520462 ADAMTS2O95450 1211 aa22.29■■□□□ 1.16
TSNARE1-206ENST00000520462 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-206ENST00000520462 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
TSNARE1-206ENST00000520462 ABCC11Q96J66 1382 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-206ENST00000520462 NGLY1Q96IV0 654 aa22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-206ENST00000520462 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TSNARE1-206ENST00000520462 TECPR2O15040 1411 aa22.25■■□□□ 1.15
TSNARE1-206ENST00000520462 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-206ENST00000520462 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
TSNARE1-206ENST00000520462 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-206ENST00000520462 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.23■■□□□ 1.15
TSNARE1-206ENST00000520462 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TSNARE1-206ENST00000520462 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-206ENST00000520462 NUTM2FA1L443 756 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 ADGRB1O14514 1584 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 SIRT1Q96EB6 747 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 RGS12O14924 1447 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 TONSLQ96HA7 1378 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 POGKQ9P215 609 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 USP21Q9UK80 565 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.17■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 DLC1Q96QB1 1528 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 FOXO3O43524 673 aa22.16■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 PRAM1Q96QH2 718 aa22.15■■□□□ 1.14
TSNARE1-206ENST00000520462 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
TSNARE1-206ENST00000520462 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-206ENST00000520462 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
TSNARE1-206ENST00000520462 PXDNQ92626 1479 aa22.11■■□□□ 1.13
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-206ENST00000520462 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TSNARE1-206ENST00000520462 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.09■■□□□ 1.13
TSNARE1-206ENST00000520462 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.08■■□□□ 1.13
TSNARE1-206ENST00000520462 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.07■■□□□ 1.12
TSNARE1-206ENST00000520462 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.06■■□□□ 1.12
TSNARE1-206ENST00000520462 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
TSNARE1-206ENST00000520462 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-206ENST00000520462 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-206ENST00000520462 ATRNO75882 1429 aa22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1-206ENST00000520462 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-206ENST00000520462 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-206ENST00000520462 ADGRB2O60241 1585 aa22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1-206ENST00000520462 KIF1AQ12756 1690 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-206ENST00000520462 PLEKHG5O94827 1062 aa22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1-206ENST00000520462 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 NBPF8Q3BBV2 869 aa22■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 PHF8Q9UPP1 1060 aa22■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 BCL9LQ86UU0 1499 aa22■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 PSME1Q06323 249 aa21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1-206ENST00000520462 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.95■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.94■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.93■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.92■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 USP32Q8NFA0 1604 aa21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 ITSN1Q15811 1721 aa21.91■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 SLIT2O94813 1529 aa21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TSNARE1-206ENST00000520462 CDK19Q9BWU1 502 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.89■■□□□ 1.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SBNO1A3KN83 1393 aa21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1-206ENST00000520462 EP400Q96L91 3159 aa21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGEF10O15013 1369 aa21.87■■□□□ 1.09
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