RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514374.5

ZNF331-222, Transcript of zinc finger protein 331, human

TSL 4

Gene ZNF331, Length 574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF331-222	ENST00000514374	COL9A1	P20849	921 aa		13.37	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	PROX2	Q3B8N5	592 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	AFAP1	Q8N556	730 aa		13.36	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	AGL	P35573	1532 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.35	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		13.34	□□□□□ -0.27
ZNF331-222	ENST00000514374	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.33	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	CLIP1	P30622	1438 aa		13.32	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.31	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	ABCC1	P33527	1531 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	PHF14	O94880	888 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.3	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.29	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	NPAT	Q14207	1427 aa		13.28	□□□□□ -0.28
ZNF331-222	ENST00000514374	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.27	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374		A0A0G2JS52	829 aa		13.26	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	DPYSL4	O14531	572 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	RGS20	O76081	388 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	BCAM	P50895	628 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.21	□□□□□ -0.29
ZNF331-222	ENST00000514374	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.21	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.2	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	EPAS1	Q99814	870 aa		13.19	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		13.17	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	DDX12P	Q92771	950 aa		13.15	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
ZNF331-222	ENST00000514374	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		13.14	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	A2M	P01023	1474 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	WBP1L	Q9NX94	342 aa		13.13	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	CPS1	P31327	1500 aa		13.12	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	HSPA1L	P34931	641 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.11	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	TOM1	O60784	492 aa		13.1	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	13.1	□□□□□ -0.31	7e-6	■■□□□ 11.4
ZNF331-222	ENST00000514374	GGT6	Q6P531	493 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.09	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
ZNF331-222	ENST00000514374	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.08	□□□□□ -0.32
ZNF331-222	ENST00000514374	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
ZNF331-222	ENST00000514374	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
ZNF331-222	ENST00000514374	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
ZNF331-222	ENST00000514374	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
ZNF331-222	ENST00000514374	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.07	□□□□□ -0.32
ZNF331-222	ENST00000514374	PDIA6	Q15084	440 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ZNF331-222	ENST00000514374	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ZNF331-222	ENST00000514374	TSKS	Q9UJT2	592 aa		13.06	□□□□□ -0.32
ZNF331-222	ENST00000514374	ALK	Q9UM73	1620 aa		13.06	□□□□□ -0.32

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